More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3679 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  76.54 
 
 
863 aa  1358    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  56.08 
 
 
864 aa  964    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.02 
 
 
858 aa  666    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  52.28 
 
 
852 aa  840    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
863 aa  1753    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  55.93 
 
 
518 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  54.31 
 
 
551 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  52.33 
 
 
539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  50.93 
 
 
561 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  47.16 
 
 
515 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  46.31 
 
 
503 aa  446  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.31 
 
 
503 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  46.11 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  47.65 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  47.79 
 
 
494 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  43.69 
 
 
494 aa  422  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  47.27 
 
 
517 aa  422  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  45.78 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  43.56 
 
 
507 aa  416  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  44.16 
 
 
513 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.28 
 
 
506 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.05 
 
 
797 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.51 
 
 
506 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  44.09 
 
 
787 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.28 
 
 
506 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  45.08 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  45.08 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  45.19 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  46.86 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  46.54 
 
 
491 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.4 
 
 
503 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.32 
 
 
514 aa  405  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  46.57 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  45.67 
 
 
495 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  45.67 
 
 
495 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  46.06 
 
 
532 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.29 
 
 
503 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  43.7 
 
 
514 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 
502 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  40.04 
 
 
772 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.94 
 
 
776 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  43.29 
 
 
488 aa  389  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  45.64 
 
 
490 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.51 
 
 
491 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  39.84 
 
 
487 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  43.75 
 
 
489 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  45.84 
 
 
490 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.68 
 
 
777 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  44.97 
 
 
490 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.38 
 
 
521 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  39.63 
 
 
487 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  45.78 
 
 
575 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.36 
 
 
485 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  45.2 
 
 
509 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.52 
 
 
484 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.9 
 
 
508 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  44.63 
 
 
484 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  42.66 
 
 
485 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44.42 
 
 
496 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.95 
 
 
484 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  46.67 
 
 
481 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  42.43 
 
 
498 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.4 
 
 
500 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.12 
 
 
484 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.52 
 
 
484 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.37 
 
 
485 aa  365  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.87 
 
 
475 aa  365  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  46.74 
 
 
484 aa  365  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.26 
 
 
489 aa  364  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.23 
 
 
490 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  44.13 
 
 
483 aa  361  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  45.42 
 
 
495 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  43.2 
 
 
509 aa  360  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  45.17 
 
 
505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  41.55 
 
 
493 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  41.89 
 
 
529 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  43.47 
 
 
483 aa  357  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  47.75 
 
 
465 aa  357  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  46.03 
 
 
496 aa  356  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  42.6 
 
 
509 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.28 
 
 
483 aa  356  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  44.9 
 
 
481 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.15 
 
 
486 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  42.6 
 
 
506 aa  355  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  43.27 
 
 
487 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  44.31 
 
 
488 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  39.76 
 
 
494 aa  355  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  40.69 
 
 
560 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  43.06 
 
 
485 aa  354  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.12 
 
 
486 aa  353  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  44.22 
 
 
484 aa  353  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  42.11 
 
 
491 aa  353  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  40 
 
 
556 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  43.69 
 
 
491 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.81 
 
 
510 aa  352  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  43.9 
 
 
501 aa  351  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.48 
 
 
490 aa  350  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.41 
 
 
495 aa  350  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  40.15 
 
 
526 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 
500 aa  350  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>