More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0211 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  64.15 
 
 		 502 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  65.1 
 
 		 491 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  100 
 
 		 491 aa  1003    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  64.56 
 
 		 491 aa  695    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  59.63 
 
 		 495 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  62.58 
 
 		 488 aa  673    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  59.63 
 
 		 495 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  62.1 
 
 		 495 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  53.23 
 
 		 506 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  52.02 
 
 		 496 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  52.24 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  48.48 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  46.15 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  46.06 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  46.28 
 
 		 509 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  45.47 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  44.98 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  47.39 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  47.84 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.31 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  46.91 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  45.47 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  44.11 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  44.73 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  44.58 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  45.71 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.28 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.95 
 
 		 776 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  43.69 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  43.46 
 
 		 772 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  43.8 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.63 
 
 		 777 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.97 
 
 		 864 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.09 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  45.93 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  46.22 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  46.67 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  44.21 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  42.55 
 
 		 787 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  46.26 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  42.49 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  42.91 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  42.51 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  44.51 
 
 		 863 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  45.28 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  48.65 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  45.4 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  43.37 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.88 
 
 		 863 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  43.43 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.33 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.6 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.15 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.4 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.6 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  43.63 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  45.84 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  46.91 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.26 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  44.04 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  43.72 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  45.49 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  46.49 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  44.63 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  44.72 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.65 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.9 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  43.12 
 
 		 858 aa  365  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  46.8 
 
 		 491 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.47 
 
 		 536 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  46.34 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  41.86 
 
 		 852 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  43.56 
 
 		 495 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  40.37 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.98 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  39.39 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  43.82 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  45.04 
 
 		 488 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 481 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 487 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.4 
 
 		 509 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  44.89 
 
 		 518 aa  354  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  43.23 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.45 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 560 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  44.04 
 
 		 512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  40.62 
 
 		 541 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 489 aa  352  7e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  43.36 
 
 		 556 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  40.56 
 
 		 502 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  42.14 
 
 		 481 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>