289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1304 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 514 aa  1053    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  53.79 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  55.84 
 
 		 517 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  48.53 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  48.33 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  50 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  48.53 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  48.93 
 
 		 512 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  47.13 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  48.24 
 
 		 864 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  47.65 
 
 		 863 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  47.67 
 
 		 787 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  48.33 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  48.05 
 
 		 863 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  46.86 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  47.98 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  47.31 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  46.67 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  46.47 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  46.67 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  45.38 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  48.34 
 
 		 797 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  48.05 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  46.64 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  46.51 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  45.81 
 
 		 539 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  46.78 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  47.16 
 
 		 532 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  46.18 
 
 		 560 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  46.35 
 
 		 501 aa  428  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  48.01 
 
 		 852 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  46.59 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 551 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  44.57 
 
 		 507 aa  422  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.94 
 
 		 777 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  46.71 
 
 		 491 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  46.26 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  45.33 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  46.28 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  44.75 
 
 		 502 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.73 
 
 		 772 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.33 
 
 		 776 aa  412  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  43.35 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  44.65 
 
 		 561 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  46.23 
 
 		 485 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.77 
 
 		 858 aa  399  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  45.85 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  42.57 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  42.57 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.64 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.19 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  44.77 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  46.12 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.34 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.93 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.15 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.02 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  44.84 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  40.52 
 
 		 487 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  41.4 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  41.59 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.39 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.07 
 
 		 560 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  41.96 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  42.02 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 491 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  43.45 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  43.14 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.42 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  43.76 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  41.02 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.38 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  43.11 
 
 		 493 aa  372  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  40.75 
 
 		 565 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  40.52 
 
 		 526 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  40.19 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  40.87 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  42.51 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  41 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40.57 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  41.48 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.19 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  42.15 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  40.85 
 
 		 523 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  40.3 
 
 		 527 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 495 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  40.65 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>