More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1739 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 514 aa  1046    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  53.45 
 
 		 772 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  53.69 
 
 		 776 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  51.76 
 
 		 797 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  51.75 
 
 		 787 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  51.37 
 
 		 532 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  47.46 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  50 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  46.99 
 
 		 777 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  48.03 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  48.03 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  47.38 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  47.64 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  47.54 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  45.85 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  46.32 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  46.58 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  44.08 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  47.03 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  44.81 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.23 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.34 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  45.28 
 
 		 864 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  44.75 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  43.24 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  46.65 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  43.7 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  45.99 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  43.25 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  42.63 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.44 
 
 		 863 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  44.88 
 
 		 502 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  44.71 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  42.32 
 
 		 863 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  43.39 
 
 		 514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.16 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  45.11 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  46.15 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.64 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.16 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  42.52 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  41.34 
 
 		 487 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  41.34 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  42.6 
 
 		 491 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  44.4 
 
 		 852 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  41.7 
 
 		 505 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.6 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  44.75 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  44.34 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  43.42 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.03 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  40.8 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  43.14 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  43.39 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  46.56 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  42.4 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44.16 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.19 
 
 		 490 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  41.43 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  43.87 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  42.52 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  41.37 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  43.17 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  42.49 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  41.98 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  42 
 
 		 484 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  41.98 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.57 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.09 
 
 		 858 aa  379  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  43.07 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  40.67 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  42.5 
 
 		 503 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  42.91 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.89 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  43.11 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  39.13 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  42.91 
 
 		 500 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.8 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  42.15 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  41.75 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  43.74 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>