291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1734 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 498 aa  1018    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  47.64 
 
 		 776 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  46.88 
 
 		 772 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  45.26 
 
 		 511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.29 
 
 		 787 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.38 
 
 		 797 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  45.89 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  47.09 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  45.51 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 505 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  45.7 
 
 		 532 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  45.22 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  44.25 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  44.71 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  47.25 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.61 
 
 		 777 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.14 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  44.84 
 
 		 864 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.14 
 
 		 481 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  42.89 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 483 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  43.35 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.35 
 
 		 484 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  48.37 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.97 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  43.81 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  44.87 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.29 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  45.07 
 
 		 491 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  42.91 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  46.56 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  47.25 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.09 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.96 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  43.81 
 
 		 491 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.06 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  43.69 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  45.71 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  42.45 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  44.04 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.95 
 
 		 486 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  46.14 
 
 		 481 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.12 
 
 		 484 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  45.11 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  41.99 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  43.27 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  42.43 
 
 		 863 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  39.26 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  46.33 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  46.42 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  44.19 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.85 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  41.93 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  47.24 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  39.02 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  43.06 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  41.32 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  46.57 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  44.04 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  45.33 
 
 		 493 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  44.04 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  44.53 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  42.24 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  41.45 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  44.08 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  43.06 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  42.71 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  42.86 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 531 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  43.43 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.2 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  41.73 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  40.73 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  44.22 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  43.57 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.14 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  41.21 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.83 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>