More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1656 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 492 aa  959    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  66.25 
 
 		 485 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  64.49 
 
 		 488 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  66.05 
 
 		 480 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  64.83 
 
 		 500 aa  561  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  65.62 
 
 		 489 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  64.42 
 
 		 500 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  59.55 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  59.55 
 
 		 506 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  64.05 
 
 		 484 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  58.86 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  61.54 
 
 		 481 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  58.54 
 
 		 481 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  60.08 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  61.33 
 
 		 481 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  60.25 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  59.38 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  57.64 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  61.08 
 
 		 486 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2096  cobyric acid synthase  60.33 
 
 		 486 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  60.71 
 
 		 481 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  59.62 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  62.73 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  60.62 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  65.12 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  59.96 
 
 		 485 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  57.29 
 
 		 491 aa  495  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  58.21 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  56.7 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  58.42 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  57.23 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  58.21 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  56.96 
 
 		 495 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  53.92 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  54.92 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  53.17 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  56.93 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  54.53 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  52.97 
 
 		 524 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  53.27 
 
 		 525 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3550  cobyric acid synthase  52.83 
 
 		 513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  50.73 
 
 		 484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  53.88 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  50 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  54.47 
 
 		 484 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  49.48 
 
 		 484 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  49.69 
 
 		 484 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  52.78 
 
 		 495 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  51.36 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3564  cobyric acid synthase  52.19 
 
 		 520 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0326183  normal  0.13415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  52 
 
 		 481 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  48.44 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  47.5 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  46.65 
 
 		 485 aa  432  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  51.13 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  51.26 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  51.68 
 
 		 498 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  51.85 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  50.52 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.83 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  50.31 
 
 		 490 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  48.66 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  48.86 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  51.86 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  45.95 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  46.22 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  49.37 
 
 		 485 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  52.06 
 
 		 545 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  49.58 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  52.26 
 
 		 512 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  52.26 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  52.26 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  51.63 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  52.26 
 
 		 535 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  52.26 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  52.26 
 
 		 531 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  49.68 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  51.21 
 
 		 504 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  50.91 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  51.33 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  51.56 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  45.21 
 
 		 534 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  44.99 
 
 		 526 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  45.98 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  49.51 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  44.84 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.12 
 
 		 797 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  51.32 
 
 		 511 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  51.32 
 
 		 510 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  51.32 
 
 		 511 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  51.83 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  50 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  44.44 
 
 		 527 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  51.02 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 556 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  44.4 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 536 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  44.99 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  45.33 
 
 		 787 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  43.71 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>