More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1456 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 495 aa  984    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  70.39 
 
 		 485 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  68.66 
 
 		 490 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  68.66 
 
 		 490 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  67.42 
 
 		 484 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  66.94 
 
 		 487 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  67.77 
 
 		 484 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  67.9 
 
 		 484 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  68.34 
 
 		 484 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  68.92 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  68.66 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  68.53 
 
 		 495 aa  618  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  67.63 
 
 		 484 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  64.54 
 
 		 483 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  67.01 
 
 		 481 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  67.91 
 
 		 498 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  66.18 
 
 		 486 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  67.99 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  65.97 
 
 		 486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  68 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  64.61 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  62.3 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  65.59 
 
 		 501 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  65.64 
 
 		 504 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  65.71 
 
 		 486 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  65.19 
 
 		 504 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  65.98 
 
 		 545 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  65.72 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  60.17 
 
 		 485 aa  588  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  65.11 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  65.92 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  65.11 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  66.33 
 
 		 500 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  65.98 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  65.98 
 
 		 523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  65.98 
 
 		 585 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  64.34 
 
 		 511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  65.98 
 
 		 529 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  63.88 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  65.98 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  65.98 
 
 		 531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  59.14 
 
 		 556 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  65.91 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  61.92 
 
 		 484 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  59.18 
 
 		 534 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  59.57 
 
 		 560 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  59.68 
 
 		 565 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  59.71 
 
 		 485 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  58.06 
 
 		 541 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  61.42 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  59.45 
 
 		 526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  57.86 
 
 		 541 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  57.78 
 
 		 541 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  58.19 
 
 		 523 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  67.22 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  59.21 
 
 		 475 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  58.88 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  58.67 
 
 		 510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  56.36 
 
 		 536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  57.53 
 
 		 527 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  58.37 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  55.06 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  58.56 
 
 		 485 aa  554  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  59.42 
 
 		 495 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  57.53 
 
 		 534 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  55.2 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  52.68 
 
 		 536 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  53.29 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  53.29 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  54.23 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  50.84 
 
 		 488 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  54.49 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  50.83 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  50.31 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  51.65 
 
 		 483 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  53.09 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  51.77 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  51.45 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  53.32 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  52.15 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  50.63 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  49.69 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  49.8 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  49.8 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  50.94 
 
 		 482 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  51.13 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  47.25 
 
 		 787 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  48.03 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  50.82 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  49.69 
 
 		 525 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  48.6 
 
 		 772 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  48.5 
 
 		 776 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  48.09 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  47.21 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  48.02 
 
 		 797 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  46.71 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  51.64 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  47.41 
 
 		 506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  51.55 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  51.02 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>