297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3731 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  66.06 
 
 		 526 aa  696    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  65.5 
 
 		 556 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  69.65 
 
 		 536 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  66.42 
 
 		 510 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  65.04 
 
 		 534 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  74.54 
 
 		 527 aa  792    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  65.8 
 
 		 560 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  66.73 
 
 		 541 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  66.54 
 
 		 541 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  65.04 
 
 		 523 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  64.31 
 
 		 534 aa  670    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  64.65 
 
 		 541 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  100 
 
 		 554 aa  1130    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  66.6 
 
 		 565 aa  698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  59.96 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  57.87 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  57.84 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  59.09 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  57.47 
 
 		 490 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  57.66 
 
 		 490 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  57.77 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  57.77 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  58.24 
 
 		 483 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  57.95 
 
 		 484 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  58.14 
 
 		 484 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  56.19 
 
 		 485 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  55.92 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  57.28 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  55.7 
 
 		 485 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  56.98 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  56.41 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  55.15 
 
 		 484 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  55.7 
 
 		 500 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  56.93 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  56.9 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  56.46 
 
 		 501 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  55.89 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  55.2 
 
 		 495 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  54.2 
 
 		 536 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  56.36 
 
 		 512 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  56.36 
 
 		 585 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  56.36 
 
 		 523 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  56.36 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  56.36 
 
 		 529 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  56.36 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  56.55 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  54.75 
 
 		 495 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  55.49 
 
 		 511 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  54.95 
 
 		 504 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  55.49 
 
 		 511 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  56.08 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  54.58 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  53.41 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  57.09 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  53.83 
 
 		 483 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  56.08 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  51.77 
 
 		 489 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  54.36 
 
 		 481 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  52.76 
 
 		 485 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  53.45 
 
 		 534 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  54.25 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  54.73 
 
 		 498 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  54.49 
 
 		 495 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  54.1 
 
 		 500 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  54.53 
 
 		 511 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.27 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  49.63 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  44.15 
 
 		 481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  46.78 
 
 		 483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  43.1 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  43.58 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  43.26 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  44.57 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  44.61 
 
 		 496 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  42.16 
 
 		 488 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  42.15 
 
 		 797 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.65 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  44.23 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  44.23 
 
 		 481 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  41.25 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  44.82 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.2 
 
 		 772 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  41.73 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.67 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  42.91 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  45.39 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  40.6 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  44.65 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  39.08 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  42.12 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.46 
 
 		 776 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  39.53 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  43.48 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  44.15 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  41.83 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  44.57 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  41.32 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.36 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  40.74 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  40.3 
 
 		 777 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>