More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1907 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
483 aa  957    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  53.12 
 
 
487 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  54.53 
 
 
490 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  54.4 
 
 
490 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  53.22 
 
 
512 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  53.43 
 
 
535 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  53.43 
 
 
585 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  53.22 
 
 
529 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  53.22 
 
 
545 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  53.22 
 
 
523 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  53.22 
 
 
531 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  54.04 
 
 
511 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  53.32 
 
 
495 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  53.42 
 
 
500 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  53.86 
 
 
520 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  54.15 
 
 
505 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  53 
 
 
500 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  49.6 
 
 
534 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  52.65 
 
 
501 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  51.75 
 
 
504 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  52.16 
 
 
504 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  47.34 
 
 
560 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  50 
 
 
484 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  51.23 
 
 
486 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  47.27 
 
 
526 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  50.73 
 
 
484 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  47.26 
 
 
485 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  51.78 
 
 
484 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  46.88 
 
 
556 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  47.07 
 
 
565 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  47.44 
 
 
527 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  50.73 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  47.67 
 
 
541 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  47.28 
 
 
541 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  47.86 
 
 
541 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  53.6 
 
 
481 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  49.9 
 
 
502 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  49.08 
 
 
489 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  46.59 
 
 
534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  50.52 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  53.21 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  52.84 
 
 
498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  52.8 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  48.77 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  53.96 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  52.8 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  46.78 
 
 
554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  50.1 
 
 
484 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  51.96 
 
 
488 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  47.23 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  49.9 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  51.98 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  45.49 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  48.05 
 
 
483 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  45.35 
 
 
523 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  51.76 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  51.77 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  50.62 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  51.26 
 
 
505 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  45.47 
 
 
500 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  51.87 
 
 
511 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  45.61 
 
 
485 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  51.04 
 
 
483 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.23 
 
 
500 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.97 
 
 
484 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  49.38 
 
 
486 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  50.93 
 
 
485 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  46.23 
 
 
495 aa  392  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  50.1 
 
 
488 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  51.25 
 
 
496 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  45.91 
 
 
534 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  45.21 
 
 
475 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  48.52 
 
 
485 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  50.62 
 
 
500 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  48.43 
 
 
481 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  47.06 
 
 
483 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  51.87 
 
 
481 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  48.54 
 
 
486 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  47.44 
 
 
483 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  50.51 
 
 
491 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  49.48 
 
 
492 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  47.1 
 
 
498 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  45.01 
 
 
536 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.56 
 
 
506 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.56 
 
 
506 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  50.62 
 
 
482 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  50.96 
 
 
488 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.35 
 
 
506 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.15 
 
 
506 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.18 
 
 
513 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  50.83 
 
 
485 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  47.24 
 
 
506 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  48.17 
 
 
509 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  51.04 
 
 
477 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  47.52 
 
 
484 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  49.06 
 
 
493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  45.73 
 
 
490 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  46 
 
 
488 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  49.79 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  47.58 
 
 
480 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>