More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3605 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  63.11 
 
 		 532 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  68.49 
 
 		 787 aa  1023    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 772 aa  1559    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  96.37 
 
 		 776 aa  1473    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  65.21 
 
 		 797 aa  984    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  59.31 
 
 		 777 aa  930    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  53.65 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  49.9 
 
 		 506 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  49.9 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  49.9 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  49.7 
 
 		 513 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  49.5 
 
 		 506 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.8 
 
 		 503 aa  452  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  45.97 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  47.09 
 
 		 506 aa  446  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  46.22 
 
 		 503 aa  442  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  47.4 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  45.29 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  46.75 
 
 		 517 aa  439  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  46.88 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  46.89 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.05 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  46.53 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  47.14 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  48.2 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  45.98 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  45.75 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 505 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  47.49 
 
 		 484 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.37 
 
 		 484 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  43.91 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  47.9 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  46.08 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  47.49 
 
 		 484 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  45.31 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  46.89 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  47.83 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  47.9 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  47.49 
 
 		 545 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  46.49 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  47 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  46.83 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  45.58 
 
 		 495 aa  416  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  46.12 
 
 		 512 aa  416  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  45.13 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  48.6 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  47 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  48.2 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  47.87 
 
 		 502 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  47.09 
 
 		 520 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  46.39 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  45.2 
 
 		 481 aa  412  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  43.63 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  45.06 
 
 		 489 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 501 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  50.11 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  45.88 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  45.38 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  43.11 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  46.35 
 
 		 511 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  44.96 
 
 		 485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.47 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.33 
 
 		 494 aa  405  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  47.7 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  47.87 
 
 		 481 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 534 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  45.53 
 
 		 498 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  46.31 
 
 		 486 aa  406  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  47.67 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  45.38 
 
 		 484 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  43.55 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  45.09 
 
 		 489 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  42.19 
 
 		 852 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  44.66 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  44.64 
 
 		 495 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.63 
 
 		 863 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  45 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  43.48 
 
 		 541 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.38 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  45.15 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  46.18 
 
 		 511 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.46 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  46.73 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  43.81 
 
 		 527 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  44.3 
 
 		 565 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  43.16 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  43.29 
 
 		 541 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  43.39 
 
 		 523 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  46.3 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  44.73 
 
 		 514 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  42.75 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.78 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>