More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0765 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  66.41 
 
 		 556 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  64.38 
 
 		 510 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  66.02 
 
 		 526 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  66.8 
 
 		 560 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  66.21 
 
 		 534 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  66.41 
 
 		 565 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  67.12 
 
 		 541 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  66.73 
 
 		 541 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  66.8 
 
 		 541 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  63.73 
 
 		 534 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  100 
 
 		 502 aa  1019    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  62.3 
 
 		 536 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  62.25 
 
 		 523 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  59.96 
 
 		 554 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  61.33 
 
 		 527 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  61.88 
 
 		 485 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  61.42 
 
 		 495 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  60.98 
 
 		 484 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  57.52 
 
 		 485 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  59.84 
 
 		 490 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  59.44 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  56.63 
 
 		 536 aa  552  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  58.17 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  61.49 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  56.25 
 
 		 484 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  61.62 
 
 		 486 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  56.18 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  58.32 
 
 		 484 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  58.92 
 
 		 484 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  58.88 
 
 		 486 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  60.2 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  59.12 
 
 		 484 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  61.49 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  58.48 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  60.71 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  58.12 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  60.56 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  60.04 
 
 		 501 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  56.42 
 
 		 485 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  60.12 
 
 		 511 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  59.8 
 
 		 504 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  57.17 
 
 		 483 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  59.88 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  59.88 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  55.84 
 
 		 489 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  59.76 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  59.76 
 
 		 545 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  59.56 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  59.55 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  59.56 
 
 		 585 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  60.4 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  59.56 
 
 		 529 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  59.56 
 
 		 523 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  59.56 
 
 		 531 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  58.92 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  54.96 
 
 		 534 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  54.81 
 
 		 475 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  60.12 
 
 		 495 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  59.51 
 
 		 498 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  58.28 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  56.83 
 
 		 510 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  58.43 
 
 		 511 aa  511  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  53.41 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  54.31 
 
 		 500 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  54.18 
 
 		 485 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  59.48 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  56.09 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  49.9 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  45.54 
 
 		 787 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.15 
 
 		 772 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.24 
 
 		 776 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  45.82 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  47.37 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.56 
 
 		 797 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  46.94 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.22 
 
 		 777 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.09 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.2 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  43.65 
 
 		 511 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  47.57 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  44.05 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.08 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.08 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  44.25 
 
 		 505 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  40.78 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.9 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 532 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  42.15 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.71 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  43.71 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  41.75 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  44.2 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44.03 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  40.93 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>