More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2992 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  100 
 
 		 532 aa  1073    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  81.3 
 
 		 797 aa  865    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  64.73 
 
 		 776 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  70.08 
 
 		 787 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  63.11 
 
 		 772 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  60.62 
 
 		 777 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  51.37 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  48.92 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  47.09 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  45.56 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  45.76 
 
 		 503 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  51.77 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.96 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  48.73 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  48.73 
 
 		 506 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  48.34 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  46.02 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  48.64 
 
 		 506 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  48.34 
 
 		 506 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  50.21 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 511 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  48.63 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  47.02 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  47.16 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  45.69 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  50.11 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  47.83 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  44.75 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  44.11 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  43.49 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  47.65 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  50 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  45.24 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  47.23 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  45.7 
 
 		 498 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 		 491 aa  403  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  46.2 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  43.82 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  47.81 
 
 		 539 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  46.06 
 
 		 863 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  43.53 
 
 		 494 aa  400  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  45.17 
 
 		 491 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.9 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  43.46 
 
 		 475 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  47.15 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  44.71 
 
 		 484 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  45.15 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  43.39 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.79 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.49 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  46.48 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.23 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  45.58 
 
 		 483 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 484 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  44.9 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  48.1 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  48.1 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.63 
 
 		 863 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  47.03 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  48.1 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  48.81 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  44.75 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  48.1 
 
 		 529 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  44.23 
 
 		 852 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  48.1 
 
 		 523 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  48.1 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  47.9 
 
 		 545 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  47.3 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 864 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.18 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  44.49 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  47.25 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  45.53 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  46.97 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  45.72 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  43.43 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  43.17 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  42.97 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.81 
 
 		 484 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  45.53 
 
 		 481 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  45.6 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  42.91 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  41.12 
 
 		 527 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  45.24 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  44.29 
 
 		 489 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  42.61 
 
 		 523 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  42.56 
 
 		 556 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  42.56 
 
 		 565 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 526 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  42.43 
 
 		 560 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  42.25 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  44.18 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  46.19 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  42.72 
 
 		 541 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  45.43 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>