295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3640 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  71.52 
 
 
495 aa  754    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  63.43 
 
 
502 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  66.73 
 
 
491 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  62.1 
 
 
491 aa  648    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  71.52 
 
 
495 aa  754    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  65.52 
 
 
488 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  68.22 
 
 
491 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
495 aa  1020    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  51 
 
 
506 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  50.5 
 
 
498 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  49.5 
 
 
496 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  50.5 
 
 
494 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  46.49 
 
 
504 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  46.18 
 
 
494 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  46.52 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  46.12 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  45.42 
 
 
509 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  45.29 
 
 
495 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  47.5 
 
 
494 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  47.99 
 
 
517 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  46.97 
 
 
515 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  47.35 
 
 
787 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  45.22 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.06 
 
 
797 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.82 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.26 
 
 
514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  45.76 
 
 
490 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.76 
 
 
503 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  47.15 
 
 
532 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  46.57 
 
 
863 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.22 
 
 
776 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  44.16 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.38 
 
 
772 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  44.62 
 
 
503 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  43.66 
 
 
494 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.95 
 
 
506 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.75 
 
 
506 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.75 
 
 
506 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.75 
 
 
513 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.95 
 
 
506 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  45.27 
 
 
501 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  43.9 
 
 
513 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  44.31 
 
 
864 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  43.81 
 
 
503 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.99 
 
 
777 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  44.47 
 
 
485 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  43.53 
 
 
518 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  44.91 
 
 
512 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  42.12 
 
 
507 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  45.77 
 
 
487 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  45.23 
 
 
496 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  42.4 
 
 
539 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  44.31 
 
 
485 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  43.35 
 
 
492 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.78 
 
 
490 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  41.78 
 
 
500 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  46.24 
 
 
489 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  43.81 
 
 
498 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  42.02 
 
 
485 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  43.93 
 
 
551 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.67 
 
 
490 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  43.12 
 
 
483 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  44.22 
 
 
852 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.24 
 
 
863 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  41.92 
 
 
491 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  44.4 
 
 
490 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.44 
 
 
509 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  44.35 
 
 
509 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  42.17 
 
 
478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  47.9 
 
 
491 aa  362  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  43.85 
 
 
495 aa  361  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.48 
 
 
493 aa  360  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  42.37 
 
 
514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  45.7 
 
 
490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.39 
 
 
500 aa  356  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  42.23 
 
 
491 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.84 
 
 
484 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  44.06 
 
 
495 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  40.97 
 
 
485 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  43.15 
 
 
481 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.91 
 
 
508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  40.67 
 
 
858 aa  352  5.9999999999999994e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  41.72 
 
 
529 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  40.69 
 
 
475 aa  352  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  42.2 
 
 
509 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.37 
 
 
536 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  42.37 
 
 
498 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  39.23 
 
 
487 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  40.64 
 
 
486 aa  349  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  39.23 
 
 
487 aa  348  8e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  44.35 
 
 
954 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  42.57 
 
 
485 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  43.29 
 
 
488 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  41.8 
 
 
487 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  41.28 
 
 
481 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  42.57 
 
 
481 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  42.74 
 
 
484 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  41.98 
 
 
511 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.86 
 
 
521 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  41.48 
 
 
534 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>