More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2912 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  100 
 
 
478 aa  977    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  62.32 
 
 
487 aa  617  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  61.32 
 
 
492 aa  588  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  60.13 
 
 
480 aa  557  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  54.56 
 
 
490 aa  508  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  51.05 
 
 
485 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  51.88 
 
 
495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  46.15 
 
 
506 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  46.56 
 
 
506 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  45.75 
 
 
506 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.75 
 
 
506 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  45.75 
 
 
513 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.72 
 
 
491 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.86 
 
 
502 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.42 
 
 
491 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  43.94 
 
 
501 aa  364  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  42.17 
 
 
495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  44.18 
 
 
787 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  42.36 
 
 
491 aa  362  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  43.96 
 
 
515 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  41.27 
 
 
513 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  44.88 
 
 
518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  41.02 
 
 
488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  41.2 
 
 
507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.35 
 
 
494 aa  355  7.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  41.84 
 
 
494 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  41.68 
 
 
776 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.74 
 
 
493 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.23 
 
 
772 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.8 
 
 
517 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.71 
 
 
508 aa  349  5e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  42.51 
 
 
514 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.5 
 
 
503 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  42.08 
 
 
797 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  41.92 
 
 
498 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.17 
 
 
484 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.08 
 
 
503 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  40.8 
 
 
503 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  41.65 
 
 
490 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  40.32 
 
 
514 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  41.28 
 
 
506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  41.08 
 
 
777 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  41.52 
 
 
511 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  44.01 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.74 
 
 
505 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  41.95 
 
 
512 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  41.63 
 
 
489 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  40.68 
 
 
496 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  40.28 
 
 
514 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  39.46 
 
 
485 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  41.67 
 
 
485 aa  333  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  41.7 
 
 
498 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  43.06 
 
 
501 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  40.76 
 
 
532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  39.46 
 
 
481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  40.21 
 
 
481 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  39.38 
 
 
475 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  42.54 
 
 
509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  40.21 
 
 
481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  40.04 
 
 
485 aa  326  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  40.2 
 
 
509 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  41.78 
 
 
496 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  40.49 
 
 
495 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  38.48 
 
 
494 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  40.37 
 
 
498 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  39.58 
 
 
487 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  40.33 
 
 
481 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  41.87 
 
 
520 aa  323  5e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  39.58 
 
 
487 aa  322  7e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  41.03 
 
 
485 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  37.8 
 
 
504 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  41.18 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  39.71 
 
 
490 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  40.37 
 
 
495 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  38.98 
 
 
536 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  37 
 
 
495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  37 
 
 
495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  39.92 
 
 
506 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  39.43 
 
 
495 aa  319  7e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  39.71 
 
 
490 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  42.83 
 
 
500 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  41.56 
 
 
481 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  40.76 
 
 
535 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  40.76 
 
 
545 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  37.99 
 
 
563 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  40.96 
 
 
512 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  39.52 
 
 
506 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  41.7 
 
 
503 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  40.96 
 
 
529 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  40.96 
 
 
523 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  41.43 
 
 
509 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  38.71 
 
 
500 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  40.96 
 
 
531 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  40.62 
 
 
480 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  39.34 
 
 
487 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  40.76 
 
 
585 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  43.15 
 
 
492 aa  316  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  42.09 
 
 
484 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  41.02 
 
 
491 aa  316  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  41.41 
 
 
503 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>