More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1901 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  100 
 
 		 480 aa  971    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  67.71 
 
 		 487 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  66.25 
 
 		 492 aa  610  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  60.13 
 
 		 478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  53.81 
 
 		 490 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  52.8 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  53.2 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.83 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.83 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.63 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  45.63 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  45.91 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  44.49 
 
 		 787 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.51 
 
 		 797 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  43.17 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  45.13 
 
 		 777 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  43.75 
 
 		 772 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.66 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  41.46 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  46.29 
 
 		 502 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  43.41 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  44.97 
 
 		 515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.89 
 
 		 776 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  44.09 
 
 		 518 aa  350  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  42.28 
 
 		 495 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  40.16 
 
 		 492 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  41.75 
 
 		 514 aa  346  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.54 
 
 		 490 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  43.09 
 
 		 491 aa  345  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.54 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  43.35 
 
 		 498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  41.85 
 
 		 495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  41.85 
 
 		 495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  43.09 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.66 
 
 		 503 aa  339  5e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  44.81 
 
 		 484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  44.19 
 
 		 484 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.06 
 
 		 505 aa  339  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  42.34 
 
 		 498 aa  338  9e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  41.43 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  39.55 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.08 
 
 		 508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  44.61 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.57 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  43.72 
 
 		 495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.58 
 
 		 484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  40.73 
 
 		 487 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.19 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.65 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  41.83 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  40.94 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  38.9 
 
 		 513 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  43.71 
 
 		 485 aa  332  9e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  40.08 
 
 		 485 aa  332  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.15 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  42.57 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  41.09 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  42.26 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  39.89 
 
 		 563 aa  330  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  43.9 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  43.48 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  44.02 
 
 		 501 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 487 aa  329  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  40.24 
 
 		 511 aa  329  6e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 486 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 535 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  41.27 
 
 		 514 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  42.71 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  44.69 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 483 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  45.34 
 
 		 509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  44.35 
 
 		 492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.71 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  40.76 
 
 		 503 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  44.17 
 
 		 491 aa  325  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  43.44 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  41.92 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  40.61 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  40.76 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  38 
 
 		 494 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  44.13 
 
 		 520 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  43.81 
 
 		 485 aa  324  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  43.47 
 
 		 500 aa  323  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  42.13 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  37.25 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.34 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  46.1 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>