More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2128 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 517 aa  1013    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  59.34 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  61.78 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  61.78 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  61.78 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  59.2 
 
 		 507 aa  538  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  55.84 
 
 		 521 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  54.84 
 
 		 575 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  54.13 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  55.6 
 
 		 501 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  53.67 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  53.82 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  54.24 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  50.48 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  52.76 
 
 		 511 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  50.69 
 
 		 498 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  50.78 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  50.48 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  53.44 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  50.29 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  50.69 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  49.41 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  47.87 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  48.63 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  48.34 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  49.9 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.11 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  47.02 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  42.72 
 
 		 523 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  43.08 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.61 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.76 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  42.1 
 
 		 534 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  40.52 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  40.49 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  43.46 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  42.15 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  38.42 
 
 		 507 aa  363  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 484 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  44.74 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  40.84 
 
 		 554 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  44.44 
 
 		 498 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  46.73 
 
 		 520 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  39.96 
 
 		 560 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  45.16 
 
 		 483 aa  360  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  39.51 
 
 		 541 aa  359  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  39.33 
 
 		 541 aa  359  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  45 
 
 		 481 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.2 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 535 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 529 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.56 
 
 		 510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 523 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  40.19 
 
 		 565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  40.15 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  46.14 
 
 		 545 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  39.14 
 
 		 541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  44.8 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  39.92 
 
 		 556 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 585 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  45.51 
 
 		 481 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.44 
 
 		 502 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.02 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  40.3 
 
 		 527 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  41.81 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  45.11 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  43.65 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  40.23 
 
 		 772 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  39.25 
 
 		 534 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.05 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.88 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  42.74 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  40.31 
 
 		 787 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  38.57 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  44.99 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.04 
 
 		 489 aa  352  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  38.36 
 
 		 500 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  42.09 
 
 		 490 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 511 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 511 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  37.86 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.31 
 
 		 776 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  41.47 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  40.48 
 
 		 485 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  41.9 
 
 		 490 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  44.67 
 
 		 486 aa  349  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  41.76 
 
 		 797 aa  349  9e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>