More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3191 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  100 
 
 		 485 aa  978    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  72.11 
 
 		 495 aa  684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  58.97 
 
 		 490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  54.28 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  51.05 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  51.56 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  52.8 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  45.6 
 
 		 515 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  45.71 
 
 		 491 aa  415  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  49.3 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.58 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  45.45 
 
 		 491 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  44.44 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  46.55 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  45.98 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  44.87 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.8 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  45.7 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  46.71 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.47 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  47.65 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.23 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  45.45 
 
 		 517 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  46.37 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  44.13 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  43.79 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  45.26 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.97 
 
 		 797 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.38 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  45.78 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  46.56 
 
 		 487 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  40.44 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  48.16 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  46.15 
 
 		 487 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  40.44 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.06 
 
 		 777 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  43.73 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.06 
 
 		 864 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  41.25 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.6 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.14 
 
 		 787 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.98 
 
 		 503 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  41.98 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  39.36 
 
 		 563 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  41.95 
 
 		 772 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  42.34 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.12 
 
 		 776 aa  362  9e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  40.76 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  42.09 
 
 		 496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  41.43 
 
 		 863 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  40.08 
 
 		 504 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  40.86 
 
 		 518 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  41.06 
 
 		 511 aa  349  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  40.93 
 
 		 492 aa  349  7e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  42.27 
 
 		 560 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  41.37 
 
 		 485 aa  346  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.72 
 
 		 863 aa  346  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  42.39 
 
 		 509 aa  342  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.02 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.23 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  41.46 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  42.26 
 
 		 495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  39.22 
 
 		 506 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  39.72 
 
 		 492 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  42.38 
 
 		 503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  38.37 
 
 		 496 aa  339  7e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  40.08 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  38.76 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  42.52 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  39.1 
 
 		 539 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 490 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0462  cobyric acid synthase  40.4 
 
 		 492 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0586994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.93 
 
 		 484 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.21 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  40.32 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 506 aa  334  3e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  37.47 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  39.28 
 
 		 484 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  38.33 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  39.56 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  40.4 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  39.55 
 
 		 483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  38.88 
 
 		 484 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  41.13 
 
 		 501 aa  329  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  40.6 
 
 		 489 aa  328  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  41.01 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  38.76 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  38.42 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  39.35 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  40.28 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  38.08 
 
 		 858 aa  326  4.0000000000000003e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  38.91 
 
 		 486 aa  326  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  41.28 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>