More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0558 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 511 aa  994    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  70.39 
 
 		 501 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  68.42 
 
 		 509 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  62.38 
 
 		 529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  65.31 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  64.21 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  66.21 
 
 		 508 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  63.97 
 
 		 520 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  62.33 
 
 		 575 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  62.55 
 
 		 521 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  58.76 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  60.04 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  61.26 
 
 		 486 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  59.8 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  57.75 
 
 		 491 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  59.84 
 
 		 527 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  60.94 
 
 		 499 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  56.8 
 
 		 494 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  58.57 
 
 		 495 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  58.57 
 
 		 495 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  57.43 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  58.57 
 
 		 495 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  55.85 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  52.76 
 
 		 517 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  54.81 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  55.42 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.44 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.44 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.44 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  45.24 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.84 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.07 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.02 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.23 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  47.08 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.46 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  44.03 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  44.96 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  42.97 
 
 		 787 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  45.1 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  46.28 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  42.16 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.58 
 
 		 772 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.31 
 
 		 776 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  44.49 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  46.67 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.24 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  44.38 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 490 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  47.98 
 
 		 496 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  44.08 
 
 		 484 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  46.61 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  44.55 
 
 		 518 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  46.8 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  43.93 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  45.51 
 
 		 481 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.63 
 
 		 501 aa  359  7e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.75 
 
 		 495 aa  359  8e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  40.73 
 
 		 777 aa  359  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.3 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  40.35 
 
 		 506 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.75 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.07 
 
 		 513 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.75 
 
 		 481 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.37 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  42.71 
 
 		 858 aa  355  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  48.16 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.6 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  44.08 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.44 
 
 		 560 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.96 
 
 		 863 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  43.14 
 
 		 510 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  39.22 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  41.97 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  45.64 
 
 		 498 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  41.86 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  47.03 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  42.14 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  44.61 
 
 		 486 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  45.7 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.92 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.05 
 
 		 503 aa  350  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.1 
 
 		 510 aa  349  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  40.08 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  41.2 
 
 		 863 aa  349  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  41.59 
 
 		 541 aa  349  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.34 
 
 		 864 aa  349  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  43.29 
 
 		 797 aa  349  8e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  41.19 
 
 		 556 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  41.51 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  44.29 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 491 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  42.02 
 
 		 565 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  41.04 
 
 		 541 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  43.72 
 
 		 852 aa  347  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 503 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  37.99 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  40.29 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>