More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5212 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  71.56 
 
 
563 aa  751    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
538 aa  1056    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  62.85 
 
 
518 aa  608  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  60.9 
 
 
498 aa  591  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  59.11 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  42.35 
 
 
485 aa  359  7e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  41.38 
 
 
777 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  42.01 
 
 
491 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  42.31 
 
 
532 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.08 
 
 
491 aa  342  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  42.38 
 
 
495 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  39.85 
 
 
490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  41.28 
 
 
797 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.3 
 
 
776 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.49 
 
 
506 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.29 
 
 
513 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  40.35 
 
 
491 aa  336  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  41.29 
 
 
506 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  39.59 
 
 
772 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  41.1 
 
 
506 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  40.9 
 
 
506 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  39.44 
 
 
487 aa  329  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  38.64 
 
 
787 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.36 
 
 
509 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  37.22 
 
 
488 aa  325  9e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  39.3 
 
 
495 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  41.44 
 
 
494 aa  324  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  39.3 
 
 
495 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  41.88 
 
 
492 aa  320  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  38.03 
 
 
503 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  38.6 
 
 
495 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  42.57 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  42.38 
 
 
490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.19 
 
 
503 aa  313  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  35.58 
 
 
487 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  35.58 
 
 
487 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  37.89 
 
 
514 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  39.3 
 
 
478 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  40.04 
 
 
514 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  39.81 
 
 
480 aa  309  9e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  38.35 
 
 
503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  39.53 
 
 
502 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  41.82 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  37.87 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  39.35 
 
 
517 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  38.08 
 
 
503 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  38.16 
 
 
493 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  38.53 
 
 
511 aa  300  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  34.75 
 
 
494 aa  299  8e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  40.78 
 
 
483 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  40.58 
 
 
506 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  37.65 
 
 
489 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  39.33 
 
 
490 aa  296  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  35.73 
 
 
512 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  35.45 
 
 
536 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  37.25 
 
 
515 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.55 
 
 
501 aa  294  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  36.06 
 
 
541 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  38.39 
 
 
505 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  41.04 
 
 
512 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  42.55 
 
 
529 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  36.43 
 
 
500 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  37.66 
 
 
498 aa  288  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  35.78 
 
 
560 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  36.66 
 
 
507 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  39.64 
 
 
490 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  36.92 
 
 
483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  40.6 
 
 
517 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  42.06 
 
 
509 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  35.84 
 
 
541 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  35.64 
 
 
534 aa  286  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  39.53 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  36.16 
 
 
556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  35.6 
 
 
541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  39.25 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  35.69 
 
 
475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  37.25 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.74 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  36.38 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  38.16 
 
 
484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  41.34 
 
 
505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  37.59 
 
 
498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  37.64 
 
 
560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  37.23 
 
 
502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  38.09 
 
 
484 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  34.86 
 
 
513 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  38.37 
 
 
489 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  35.91 
 
 
510 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  35.47 
 
 
484 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  37.97 
 
 
484 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  39.3 
 
 
491 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  35.51 
 
 
565 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  39.07 
 
 
521 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  35.35 
 
 
526 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  40.33 
 
 
507 aa  281  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  37.09 
 
 
523 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  40.2 
 
 
485 aa  280  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  40.4 
 
 
486 aa  280  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  35.77 
 
 
506 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  38.24 
 
 
495 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>