More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0138 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  100 
 
 		 486 aa  961    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  63.28 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  62.29 
 
 		 509 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  61.51 
 
 		 501 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  58.47 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  61.26 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  56.21 
 
 		 529 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  58.4 
 
 		 521 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  59.5 
 
 		 495 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  59.88 
 
 		 490 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  57.72 
 
 		 575 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  56.88 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  56.33 
 
 		 512 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  57 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  58.68 
 
 		 527 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  57.2 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  53.55 
 
 		 517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  56.31 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  56.97 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  55.28 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  54.53 
 
 		 520 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  52.75 
 
 		 507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  55.79 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  55.79 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  55.79 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  51.86 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.58 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.77 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.38 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  40.76 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.88 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.09 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  37.6 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  42.63 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  46.5 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  45.45 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  44.53 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  42.75 
 
 		 565 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 556 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  46.72 
 
 		 485 aa  362  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.24 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 526 aa  359  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.76 
 
 		 502 aa  359  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  42.35 
 
 		 534 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  38.79 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  42.19 
 
 		 777 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.29 
 
 		 490 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  43.25 
 
 		 510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  40.73 
 
 		 491 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  46.01 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.31 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  41.32 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.67 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.42 
 
 		 489 aa  353  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  42.25 
 
 		 541 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.76 
 
 		 484 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  40.49 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.67 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  43 
 
 		 534 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  45.85 
 
 		 501 aa  350  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.85 
 
 		 484 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  40.64 
 
 		 495 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  41.5 
 
 		 503 aa  349  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  41.48 
 
 		 772 aa  349  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  41.55 
 
 		 541 aa  349  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  41.55 
 
 		 541 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.33 
 
 		 536 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.02 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  41.68 
 
 		 776 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  39.36 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.52 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  38.92 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  39.35 
 
 		 491 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.12 
 
 		 863 aa  346  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.31 
 
 		 481 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.74 
 
 		 483 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.56 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.06 
 
 		 484 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  45.89 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  39.46 
 
 		 475 aa  343  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  45.29 
 
 		 504 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  46.8 
 
 		 505 aa  343  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  39.76 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 487 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  42.77 
 
 		 491 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  39.51 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  41.98 
 
 		 523 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  45.66 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  41.45 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  40.53 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.12 
 
 		 503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  45.56 
 
 		 511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  45.56 
 
 		 511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.28 
 
 		 495 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  38.7 
 
 		 787 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>