More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0360 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  100 
 
 
491 aa  967    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  75.26 
 
 
527 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  80.36 
 
 
494 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  73.29 
 
 
498 aa  654    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  70.62 
 
 
495 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  74.08 
 
 
476 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  84.52 
 
 
490 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  58.47 
 
 
486 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  55.38 
 
 
529 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  57.2 
 
 
575 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  58.28 
 
 
509 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  60 
 
 
501 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  60.08 
 
 
501 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  57.4 
 
 
521 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  57.75 
 
 
511 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  55.07 
 
 
507 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  54.9 
 
 
512 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  56.39 
 
 
509 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  55.23 
 
 
509 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  54.21 
 
 
520 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  54.65 
 
 
508 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  53.96 
 
 
499 aa  435  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  50.1 
 
 
517 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  53.13 
 
 
495 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  53.13 
 
 
495 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  53.13 
 
 
495 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  48.57 
 
 
485 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  48.67 
 
 
481 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  47.11 
 
 
483 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  48.47 
 
 
481 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  47.71 
 
 
485 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  47.63 
 
 
490 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  46.35 
 
 
488 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  47.22 
 
 
490 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  45.7 
 
 
484 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  45.87 
 
 
483 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  46.54 
 
 
495 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  44.01 
 
 
484 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  42.39 
 
 
485 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.49 
 
 
484 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  44.67 
 
 
484 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  45.45 
 
 
506 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  44.22 
 
 
498 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  47.11 
 
 
483 aa  362  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  47.24 
 
 
481 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  46.25 
 
 
491 aa  362  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.74 
 
 
475 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  45.32 
 
 
487 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.13 
 
 
536 aa  360  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.4 
 
 
517 aa  358  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.29 
 
 
485 aa  358  8e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.5 
 
 
500 aa  358  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  44.38 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.97 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  45.79 
 
 
493 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.11 
 
 
510 aa  356  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  42.23 
 
 
495 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.84 
 
 
489 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  42.68 
 
 
534 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  40.79 
 
 
506 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  40.39 
 
 
527 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  41.01 
 
 
491 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  45.4 
 
 
505 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  41.02 
 
 
554 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  42.92 
 
 
481 aa  350  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  42.03 
 
 
560 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  40.74 
 
 
495 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.03 
 
 
494 aa  349  8e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  45.64 
 
 
495 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  40.59 
 
 
513 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  42.62 
 
 
858 aa  347  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  39.01 
 
 
507 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  44.49 
 
 
481 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  47.06 
 
 
483 aa  347  4e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  44.2 
 
 
498 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  45.79 
 
 
485 aa  346  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  41.24 
 
 
491 aa  345  8e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  41.61 
 
 
491 aa  345  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  41.42 
 
 
565 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  45.77 
 
 
520 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  40.76 
 
 
506 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.12 
 
 
486 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  43.2 
 
 
488 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  41.22 
 
 
556 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  39.31 
 
 
500 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.15 
 
 
501 aa  345  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  41.65 
 
 
503 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  43.71 
 
 
484 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  37.75 
 
 
514 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  47.12 
 
 
505 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  46.89 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.42 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  41.3 
 
 
541 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  40.56 
 
 
506 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  40.2 
 
 
506 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  41.29 
 
 
772 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  41.58 
 
 
510 aa  342  8e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  45.06 
 
 
545 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  43.62 
 
 
480 aa  342  9e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.38 
 
 
494 aa  342  9e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>