290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5369 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  64.86 
 
 		 485 aa  668    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  100 
 
 		 491 aa  1018    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  45.99 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  46.46 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  46.2 
 
 		 507 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  45.6 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.59 
 
 		 787 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  46.34 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  46.09 
 
 		 517 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.56 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  45.67 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.73 
 
 		 776 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.62 
 
 		 772 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  45.26 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 506 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  42.33 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.26 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.26 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  44.18 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  45.06 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.6 
 
 		 777 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  42.69 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.07 
 
 		 532 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.29 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  45.25 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.2 
 
 		 797 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  42.45 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  42.45 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  45.69 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  43.57 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  43.7 
 
 		 864 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  41.92 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  44.62 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  43.43 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.12 
 
 		 502 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  45.29 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  40.85 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  42.01 
 
 		 518 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.88 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  40.85 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.24 
 
 		 863 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  42.08 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  39.68 
 
 		 491 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  42.11 
 
 		 863 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  43.66 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.55 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  40.68 
 
 		 539 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  41.61 
 
 		 491 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.82 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  40.79 
 
 		 485 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 490 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.25 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.04 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40 
 
 		 536 aa  353  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  41.48 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  39.88 
 
 		 858 aa  351  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 487 aa  351  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  40.36 
 
 		 852 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  42.38 
 
 		 486 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  41.72 
 
 		 534 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  40.57 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  40.13 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  41.09 
 
 		 504 aa  346  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  41.14 
 
 		 485 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  40.24 
 
 		 500 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  42.59 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  40.93 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  40.13 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  39.53 
 
 		 523 aa  343  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  41.96 
 
 		 486 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  40.33 
 
 		 484 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  40.99 
 
 		 498 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.54 
 
 		 500 aa  342  7e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  40.28 
 
 		 541 aa  342  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  41.23 
 
 		 489 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  42.36 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  39.63 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  40.49 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  40.59 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  41.91 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  41.2 
 
 		 490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  40.3 
 
 		 484 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  40.57 
 
 		 486 aa  339  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  41.31 
 
 		 509 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  41.34 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  39.79 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  42.14 
 
 		 483 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  40.75 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  40.37 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  43.79 
 
 		 495 aa  336  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  39.2 
 
 		 551 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  39.72 
 
 		 541 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  40.04 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  42.77 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>