292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3957 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  68.93 
 
 
491 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  66.73 
 
 
495 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  62.58 
 
 
491 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  63.14 
 
 
502 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  65.52 
 
 
495 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  100 
 
 
488 aa  1000    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  68.23 
 
 
491 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  66.73 
 
 
495 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  49.7 
 
 
496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  49.8 
 
 
498 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  49.8 
 
 
506 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  47.86 
 
 
494 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  47.45 
 
 
504 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  49.7 
 
 
494 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  47.7 
 
 
509 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  46.98 
 
 
495 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  46.89 
 
 
509 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  48.4 
 
 
510 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  47.54 
 
 
494 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  46.2 
 
 
517 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.91 
 
 
503 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  44.75 
 
 
515 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  43.91 
 
 
506 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.6 
 
 
797 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  45.16 
 
 
490 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  43.37 
 
 
503 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  43.79 
 
 
513 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  43.53 
 
 
503 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.69 
 
 
506 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.33 
 
 
503 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  43.35 
 
 
514 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.48 
 
 
513 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.68 
 
 
777 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 
863 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  43 
 
 
507 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.28 
 
 
506 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  45.83 
 
 
501 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.28 
 
 
506 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  43.49 
 
 
512 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.28 
 
 
506 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  44.74 
 
 
487 aa  391  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  41.7 
 
 
772 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  42.61 
 
 
787 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.06 
 
 
776 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  43.3 
 
 
489 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.09 
 
 
532 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  44.13 
 
 
485 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  42.07 
 
 
490 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 
514 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  40.23 
 
 
539 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.89 
 
 
863 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  42.44 
 
 
484 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  41.75 
 
 
492 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  42.97 
 
 
490 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  39.47 
 
 
864 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  41.57 
 
 
494 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  41.94 
 
 
534 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.21 
 
 
484 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  41.15 
 
 
487 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  41.15 
 
 
487 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  42.94 
 
 
490 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.66 
 
 
508 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  42.42 
 
 
485 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  41.84 
 
 
509 aa  363  6e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  40.56 
 
 
518 aa  362  9e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  42.8 
 
 
484 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.6 
 
 
486 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  41.27 
 
 
483 aa  360  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  42.42 
 
 
490 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  41.27 
 
 
506 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.86 
 
 
483 aa  359  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.21 
 
 
536 aa  359  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  42.8 
 
 
484 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.48 
 
 
514 aa  359  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  41.33 
 
 
496 aa  359  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  42.35 
 
 
560 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.8 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  41.02 
 
 
478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  42.39 
 
 
484 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  41.72 
 
 
502 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  41.72 
 
 
495 aa  356  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  40.04 
 
 
483 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  41.07 
 
 
485 aa  355  7.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  38.48 
 
 
561 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  39.44 
 
 
500 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  40 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  40.74 
 
 
852 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  42.92 
 
 
486 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
485 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  39.47 
 
 
551 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  42.65 
 
 
483 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  39.88 
 
 
509 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  38.98 
 
 
858 aa  351  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  40.37 
 
 
509 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  41.36 
 
 
487 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  41.06 
 
 
485 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  43.43 
 
 
495 aa  350  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  41.72 
 
 
485 aa  348  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  41.19 
 
 
491 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  39.88 
 
 
541 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>