258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2177 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 561 aa  1108    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  55.27 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  56.41 
 
 		 551 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  53.66 
 
 		 518 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  53.16 
 
 		 852 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  49.63 
 
 		 864 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  49.63 
 
 		 863 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  50.93 
 
 		 863 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  47.41 
 
 		 858 aa  428  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  46.49 
 
 		 517 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  44.3 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.75 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  44.65 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.99 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.73 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.15 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  43.07 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  44.81 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  40.97 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.6 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  46.58 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.67 
 
 		 503 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  42.09 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.46 
 
 		 506 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.28 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.28 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  42.49 
 
 		 777 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.28 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.28 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 491 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  41.51 
 
 		 772 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.03 
 
 		 776 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  42.33 
 
 		 532 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.71 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.7 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  44.28 
 
 		 489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  37.85 
 
 		 507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.27 
 
 		 501 aa  356  5.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  42.19 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  41.19 
 
 		 503 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  38.48 
 
 		 488 aa  354  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.75 
 
 		 484 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  44.38 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  44.92 
 
 		 484 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.93 
 
 		 485 aa  349  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  44.73 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  44.36 
 
 		 484 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  45.25 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.9 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  44.28 
 
 		 484 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  41.54 
 
 		 512 aa  347  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  41.94 
 
 		 490 aa  346  7e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  41.67 
 
 		 494 aa  345  8.999999999999999e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.99 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  45.25 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  39.78 
 
 		 495 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  39.78 
 
 		 495 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  40.33 
 
 		 489 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  41.77 
 
 		 495 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  44.28 
 
 		 487 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  43.56 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  43.01 
 
 		 575 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  42.13 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  45.12 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  45.99 
 
 		 495 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.54 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  40.11 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  45.27 
 
 		 504 aa  339  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  41.35 
 
 		 523 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  43.23 
 
 		 509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  43.84 
 
 		 484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  45.76 
 
 		 505 aa  336  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 502 aa  337  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.58 
 
 		 475 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 536 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.42 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  44.26 
 
 		 512 aa  336  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  40.66 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  43.89 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  44.3 
 
 		 481 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 486 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  42.46 
 
 		 483 aa  334  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  38.81 
 
 		 485 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  40.82 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  40.21 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  42.09 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  39.29 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  45.11 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.54 
 
 		 521 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  41.11 
 
 		 498 aa  329  7e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  39.96 
 
 		 556 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  44.05 
 
 		 505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  40.26 
 
 		 534 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  40.47 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  39.33 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  40.58 
 
 		 541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  41.74 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  40 
 
 		 560 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  40.4 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  40.8 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>