More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0766 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  76.16 
 
 
496 aa  756    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  100 
 
 
498 aa  999    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  67.33 
 
 
506 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  57.26 
 
 
504 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  56.28 
 
 
494 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  57.09 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  50.3 
 
 
509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  51 
 
 
509 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  50.5 
 
 
510 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  50.71 
 
 
495 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  49.8 
 
 
488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  51.61 
 
 
491 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  53.4 
 
 
502 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  50.2 
 
 
491 aa  508  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  52.24 
 
 
491 aa  500  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  50.5 
 
 
495 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  49.3 
 
 
495 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  49.3 
 
 
495 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.15 
 
 
494 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  42.69 
 
 
487 aa  352  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  39.92 
 
 
787 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  44.74 
 
 
481 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  41.43 
 
 
514 aa  346  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  41.76 
 
 
539 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  44.53 
 
 
481 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  41.92 
 
 
478 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.92 
 
 
501 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  43.15 
 
 
863 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  40.8 
 
 
503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  39.31 
 
 
503 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  40.36 
 
 
490 aa  342  8e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  37.96 
 
 
503 aa  342  9e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  40.28 
 
 
515 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  40.78 
 
 
777 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.28 
 
 
863 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  41.45 
 
 
492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  40.16 
 
 
517 aa  332  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  39.84 
 
 
514 aa  332  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  38.95 
 
 
772 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  37.48 
 
 
506 aa  331  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 
776 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  36.51 
 
 
503 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.16 
 
 
489 aa  330  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  42.74 
 
 
490 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  40.12 
 
 
518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  38.76 
 
 
864 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.5 
 
 
797 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  41.37 
 
 
481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  40.37 
 
 
561 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  42.54 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  42.05 
 
 
495 aa  326  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  39.33 
 
 
512 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  41.18 
 
 
490 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  36.24 
 
 
507 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  40.97 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  34.66 
 
 
494 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  39.32 
 
 
858 aa  321  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  43.9 
 
 
481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  39.73 
 
 
532 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  42.35 
 
 
490 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  41.77 
 
 
488 aa  320  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  37.47 
 
 
485 aa  320  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  42.17 
 
 
500 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  41.87 
 
 
485 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  40.33 
 
 
484 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  39.22 
 
 
534 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  38.14 
 
 
485 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.45 
 
 
500 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  38.65 
 
 
484 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  42.17 
 
 
500 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  40.77 
 
 
498 aa  317  3e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  40.33 
 
 
483 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  39.4 
 
 
506 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  39.09 
 
 
513 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  39.2 
 
 
506 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  39.38 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  39.2 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  39.71 
 
 
852 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  37.57 
 
 
500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  40.45 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  39.4 
 
 
506 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  38.32 
 
 
495 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  39.67 
 
 
483 aa  312  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  40.82 
 
 
484 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  40.2 
 
 
485 aa  312  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  40.33 
 
 
484 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  40.57 
 
 
487 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  39.56 
 
 
508 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  41.97 
 
 
492 aa  310  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  42.14 
 
 
512 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  40.56 
 
 
509 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  37.48 
 
 
505 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  40.64 
 
 
551 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  41.68 
 
 
491 aa  309  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  40.95 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  40.04 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  38.68 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  37.04 
 
 
475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  37.82 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  41.73 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>