268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1854 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  68.12 
 
 		 518 aa  644    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  100 
 
 		 498 aa  987    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  65.54 
 
 		 520 aa  620  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  60.71 
 
 		 538 aa  585  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  58.39 
 
 		 563 aa  580  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  45.78 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  45.58 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  48.66 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 487 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.27 
 
 		 797 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  42.75 
 
 		 787 aa  347  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  43.61 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.43 
 
 		 772 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.83 
 
 		 776 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.19 
 
 		 491 aa  342  8e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  41.93 
 
 		 777 aa  342  8e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  44.01 
 
 		 478 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 491 aa  336  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.81 
 
 		 488 aa  335  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.51 
 
 		 506 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  41.4 
 
 		 491 aa  333  6e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  41.83 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.12 
 
 		 506 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.11 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  39.83 
 
 		 495 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  39.83 
 
 		 495 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  43.35 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.92 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  41.96 
 
 		 502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  40.75 
 
 		 514 aa  326  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.16 
 
 		 517 aa  326  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44.33 
 
 		 496 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  41.04 
 
 		 503 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  40.08 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  40.77 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 505 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  40.25 
 
 		 515 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  41.58 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  41.62 
 
 		 503 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  40.4 
 
 		 494 aa  313  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  41.51 
 
 		 493 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  41.43 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  43.43 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.98 
 
 		 511 aa  309  8e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  38.89 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.63 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  40.82 
 
 		 518 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  38.37 
 
 		 512 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.04 
 
 		 513 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  35.58 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  39.29 
 
 		 560 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  33.53 
 
 		 509 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  42.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.92 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  43.79 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  44.16 
 
 		 509 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  38.2 
 
 		 487 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.71 
 
 		 490 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.72 
 
 		 503 aa  302  9e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  38.4 
 
 		 506 aa  302  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  35.55 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  40.64 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  45.77 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  40.81 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  38.33 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  39.52 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  39.92 
 
 		 506 aa  300  5e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  35.5 
 
 		 509 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  41.51 
 
 		 498 aa  299  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  39.65 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.15 
 
 		 521 aa  296  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  39.29 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.2 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  41.72 
 
 		 510 aa  294  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  40.34 
 
 		 503 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  40.25 
 
 		 508 aa  293  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  38.1 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  41.36 
 
 		 506 aa  293  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  43.2 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 		 517 aa  292  8e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  42.05 
 
 		 495 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  41.36 
 
 		 483 aa  292  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  39.52 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  41.3 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  40.47 
 
 		 523 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  35.02 
 
 		 494 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  34.8 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  40.79 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  40.09 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.05 
 
 		 560 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  40.62 
 
 		 527 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  35.97 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.47 
 
 		 510 aa  290  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  39.73 
 
 		 502 aa  290  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>