294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3068 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  71.56 
 
 
538 aa  737    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
563 aa  1122    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  60.36 
 
 
518 aa  590  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  58.39 
 
 
498 aa  580  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  57.45 
 
 
520 aa  550  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  41.73 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  39.36 
 
 
485 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  41 
 
 
490 aa  342  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  40.43 
 
 
532 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  39.12 
 
 
487 aa  331  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  40.21 
 
 
492 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.4 
 
 
797 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  38.46 
 
 
772 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  39.12 
 
 
776 aa  326  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  36.7 
 
 
506 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  36.7 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  39.89 
 
 
480 aa  321  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  36.52 
 
 
513 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  36.52 
 
 
506 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  37.99 
 
 
478 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  38.43 
 
 
491 aa  317  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  36.17 
 
 
506 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  37.24 
 
 
495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  37.71 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  37.24 
 
 
495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  36.95 
 
 
787 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  36.99 
 
 
495 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  36.73 
 
 
491 aa  313  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  37.07 
 
 
503 aa  312  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  35.7 
 
 
488 aa  310  5.9999999999999995e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  36.22 
 
 
777 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  40.49 
 
 
529 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  42.17 
 
 
509 aa  306  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  36.38 
 
 
514 aa  306  9.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  38.98 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  38.38 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  35.81 
 
 
515 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  36.21 
 
 
503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  36.76 
 
 
501 aa  303  7.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  36.33 
 
 
514 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  36.38 
 
 
506 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  37.57 
 
 
490 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  34.01 
 
 
513 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  35.88 
 
 
503 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  33.45 
 
 
494 aa  297  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  38.86 
 
 
518 aa  297  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  40.7 
 
 
496 aa  296  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  35.5 
 
 
503 aa  292  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  34.62 
 
 
487 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  37.72 
 
 
489 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  34.62 
 
 
487 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  38.99 
 
 
490 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  39.81 
 
 
490 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  36.92 
 
 
517 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  37.5 
 
 
491 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  38.83 
 
 
490 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  35.81 
 
 
512 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  38.76 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  37.14 
 
 
500 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  41.86 
 
 
512 aa  283  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  39.97 
 
 
501 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  37.87 
 
 
539 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  39.35 
 
 
575 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  33.56 
 
 
507 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  35.87 
 
 
541 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  35.31 
 
 
536 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  38.46 
 
 
483 aa  280  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  35.85 
 
 
560 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  40.75 
 
 
513 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  38.64 
 
 
496 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  39.08 
 
 
509 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  39.25 
 
 
511 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  35.96 
 
 
493 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  38.27 
 
 
506 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  34.96 
 
 
864 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  35.93 
 
 
541 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  36.31 
 
 
485 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  37.91 
 
 
551 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  36.5 
 
 
560 aa  277  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  36.04 
 
 
556 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  36.26 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  36.96 
 
 
561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  37.76 
 
 
517 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.3 
 
 
499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  36.04 
 
 
541 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  36.45 
 
 
534 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  36.56 
 
 
526 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  40 
 
 
483 aa  273  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  35.92 
 
 
502 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  36.29 
 
 
511 aa  272  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  37.31 
 
 
510 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
545 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
535 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  37.45 
 
 
483 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  38.11 
 
 
507 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  39.39 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
531 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
529 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  35.47 
 
 
505 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>