267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1259 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  74.74 
 
 
490 aa  712    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  73.77 
 
 
490 aa  720    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  66.39 
 
 
489 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  100 
 
 
491 aa  979    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.31 
 
 
787 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.67 
 
 
777 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  46.56 
 
 
514 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.11 
 
 
797 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  45.77 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.52 
 
 
776 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.74 
 
 
772 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  46.71 
 
 
491 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  45.22 
 
 
506 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  46.22 
 
 
515 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  46.32 
 
 
481 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  45.22 
 
 
491 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  46.81 
 
 
517 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  47.9 
 
 
495 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.24 
 
 
496 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45 
 
 
503 aa  388  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  43.91 
 
 
532 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  44.78 
 
 
503 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  46.8 
 
 
491 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  43.11 
 
 
864 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  47.33 
 
 
502 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  42.16 
 
 
507 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.54 
 
 
505 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  44.27 
 
 
495 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  44.27 
 
 
495 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  47.86 
 
 
477 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  41.56 
 
 
539 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  44.53 
 
 
514 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  47.29 
 
 
481 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  43.69 
 
 
863 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  41.19 
 
 
488 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  40.96 
 
 
511 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  46.48 
 
 
509 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.56 
 
 
481 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  45.36 
 
 
512 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  41.32 
 
 
503 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.43 
 
 
494 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  46.12 
 
 
508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  45.71 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.03 
 
 
863 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.63 
 
 
506 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  41.63 
 
 
506 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  48.25 
 
 
512 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  45.77 
 
 
483 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  41.83 
 
 
506 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  46.94 
 
 
495 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  41.63 
 
 
506 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  46.88 
 
 
481 aa  359  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.43 
 
 
513 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  43.98 
 
 
485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  45.82 
 
 
488 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  45.32 
 
 
483 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  43.3 
 
 
498 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  44.99 
 
 
484 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  46.53 
 
 
484 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  45.3 
 
 
506 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  41.53 
 
 
852 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.68 
 
 
490 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  41.32 
 
 
541 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  41.81 
 
 
502 aa  352  7e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  46.44 
 
 
482 aa  352  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  43.68 
 
 
490 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  44.16 
 
 
483 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.68 
 
 
490 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  46.61 
 
 
488 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.34 
 
 
475 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  45.64 
 
 
500 aa  350  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  42.65 
 
 
495 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  45.4 
 
 
509 aa  349  5e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  43.33 
 
 
513 aa  349  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  41.24 
 
 
487 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  40.92 
 
 
541 aa  350  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  40.72 
 
 
541 aa  349  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.14 
 
 
485 aa  348  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  41.4 
 
 
503 aa  348  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  46.61 
 
 
484 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  44.02 
 
 
480 aa  348  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  47.62 
 
 
494 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.93 
 
 
510 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  44.89 
 
 
501 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  44 
 
 
509 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  47.24 
 
 
480 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  47.78 
 
 
484 aa  347  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  41.03 
 
 
487 aa  346  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  45.33 
 
 
484 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  37.48 
 
 
494 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  47.08 
 
 
494 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.66 
 
 
484 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  41.14 
 
 
503 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  40.04 
 
 
495 aa  345  8.999999999999999e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  42.45 
 
 
523 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  45.07 
 
 
485 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  41.18 
 
 
534 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  45.23 
 
 
500 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  45.88 
 
 
489 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  45.4 
 
 
496 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>