296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3563 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  100 
 
 		 484 aa  941    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  61.9 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3564  cobyric acid synthase  64.23 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0326183  normal  0.13415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3550  cobyric acid synthase  62.96 
 
 		 513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  60.53 
 
 		 524 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  61.27 
 
 		 524 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  61.07 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  60 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  57.83 
 
 		 481 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  57.62 
 
 		 481 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  56.16 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  53.94 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  54.17 
 
 		 481 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  53.85 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  58.04 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  53.73 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  58.04 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  53.83 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  54.22 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  54.89 
 
 		 486 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  56.58 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  54.24 
 
 		 485 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  56.73 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  58.14 
 
 		 485 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  56.22 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  52.94 
 
 		 488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  56.28 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  57.68 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  56.22 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  56.85 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  58.25 
 
 		 477 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  51.44 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  55.35 
 
 		 482 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  53.68 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  54.39 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  54.6 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  53.27 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  54.26 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  54.56 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  56.5 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  52.07 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  52.29 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2096  cobyric acid synthase  54.72 
 
 		 486 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  52.1 
 
 		 481 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  51.33 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  46.99 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  52.41 
 
 		 495 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  51.37 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.22 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  48.75 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  48.33 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  48.24 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  48.54 
 
 		 484 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.09 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  49.79 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  44.38 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  50 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  50.31 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  45.3 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  47.92 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  47.85 
 
 		 489 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  49.06 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  48.44 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  50.31 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.49 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  52.17 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  50.3 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  43.63 
 
 		 475 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  50 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  45.76 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  48.87 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  48.45 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  47.99 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  49.17 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  47.33 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  44.86 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  44.62 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  44.05 
 
 		 787 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.82 
 
 		 797 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  47.6 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  42.5 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  49.49 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.2 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.05 
 
 		 777 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  49.38 
 
 		 545 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  49.38 
 
 		 535 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  49.38 
 
 		 585 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  43.74 
 
 		 534 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  49.18 
 
 		 512 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  42.22 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  49.18 
 
 		 529 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  49.18 
 
 		 523 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  49.18 
 
 		 531 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.47 
 
 		 532 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  48.02 
 
 		 483 aa  362  9e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  49.59 
 
 		 520 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  48.27 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.6 
 
 		 772 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  47.83 
 
 		 490 aa  361  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  49.08 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>