More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0789 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  89.68 
 
 		 494 aa  847    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  80.86 
 
 		 493 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  88.64 
 
 		 495 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  100 
 
 		 494 aa  987    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  66.32 
 
 		 481 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  66.11 
 
 		 481 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  65.07 
 
 		 481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  60.21 
 
 		 481 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  65.55 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  63.31 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  59.38 
 
 		 483 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  58.66 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  59.17 
 
 		 506 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  59.96 
 
 		 486 aa  558  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  60.5 
 
 		 485 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  61.36 
 
 		 500 aa  551  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  58.74 
 
 		 488 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  60.29 
 
 		 488 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  60.74 
 
 		 500 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  60.21 
 
 		 480 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  58.09 
 
 		 485 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  58.32 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  60.68 
 
 		 489 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  61.01 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  57.89 
 
 		 484 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  59.79 
 
 		 484 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2096  cobyric acid synthase  59.63 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  57.2 
 
 		 480 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  58.28 
 
 		 491 aa  528  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  59.21 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  55.47 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  54.64 
 
 		 488 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  56.29 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  59.25 
 
 		 485 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  58.09 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  55.44 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  54.12 
 
 		 524 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  58.42 
 
 		 492 aa  512  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  54.66 
 
 		 524 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3550  cobyric acid synthase  53.88 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3564  cobyric acid synthase  53.46 
 
 		 520 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0326183  normal  0.13415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  50.62 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  55.15 
 
 		 484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  56.13 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  50.84 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  53.28 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  52.31 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  52.1 
 
 		 484 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  52.71 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  53.64 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  55.23 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  51.68 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  53.44 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  54.24 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  52.08 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  49.39 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  48.76 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.71 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  53.77 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  53.88 
 
 		 498 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  48.98 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  48.63 
 
 		 484 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  49.38 
 
 		 483 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  52.06 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  55.07 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  50.31 
 
 		 534 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  50.1 
 
 		 487 aa  428  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  51.34 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  50.41 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  47.55 
 
 		 536 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  50.64 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  51.56 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  48.96 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  50.42 
 
 		 486 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  47.72 
 
 		 560 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  47.84 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  46.14 
 
 		 527 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  52.25 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  52.46 
 
 		 545 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  52.25 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  52.25 
 
 		 529 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  52.25 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  52.46 
 
 		 535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  47.73 
 
 		 526 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  47.13 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  47.13 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  52.25 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  48.03 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  47.73 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  47.53 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  51.51 
 
 		 511 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  51.33 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  46.94 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  50.3 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  48.15 
 
 		 511 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  46.76 
 
 		 534 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  50.32 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  50.74 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  50.8 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  50.61 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>