More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1117 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  76 
 
 		 503 aa  780    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  70.28 
 
 		 511 aa  746    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  71.08 
 
 		 506 aa  723    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  64.69 
 
 		 493 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  65.51 
 
 		 495 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  74.75 
 
 		 503 aa  749    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  100 
 
 		 505 aa  1033    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.6 
 
 		 772 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  45.97 
 
 		 787 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.68 
 
 		 797 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.06 
 
 		 776 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.11 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  43.8 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  41.7 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.65 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  43.16 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.12 
 
 		 777 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  43.88 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  42.77 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  42.97 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  42.88 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.75 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.84 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  42.19 
 
 		 541 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  43.9 
 
 		 487 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  42.31 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.14 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  43.46 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  44.73 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  43.88 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.68 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  42.07 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.11 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  41.38 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.94 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  44.25 
 
 		 502 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.97 
 
 		 475 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 510 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  43.88 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  43.7 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.04 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  41.41 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  42.19 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  42.41 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  41.41 
 
 		 526 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  41.49 
 
 		 565 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.83 
 
 		 560 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  41.7 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  43.57 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  43.12 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  41.32 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  41.99 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  41.94 
 
 		 527 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.09 
 
 		 489 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  43.2 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.12 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 487 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.24 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  45.12 
 
 		 488 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  42.13 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  44.06 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.47 
 
 		 486 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  42.01 
 
 		 490 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 491 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.94 
 
 		 863 aa  362  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.03 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.21 
 
 		 486 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  42.91 
 
 		 495 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  41 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 485 aa  359  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  39.84 
 
 		 536 aa  358  9e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  41.04 
 
 		 503 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  44.09 
 
 		 498 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.49 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.22 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  42.04 
 
 		 514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  41.72 
 
 		 484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  43.69 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 482 aa  356  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  41.3 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 		 477 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  43.52 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  43.95 
 
 		 535 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  43.95 
 
 		 545 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  41.58 
 
 		 502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  43.25 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  44.15 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  43.75 
 
 		 512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 488 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  43.75 
 
 		 529 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>