More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1066 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  64.63 
 
 		 493 aa  672    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  74.25 
 
 		 511 aa  771    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  72.51 
 
 		 506 aa  734    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  100 
 
 		 503 aa  1026    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  75.66 
 
 		 503 aa  770    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  74.75 
 
 		 505 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  63.47 
 
 		 495 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  46.28 
 
 		 772 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  45.97 
 
 		 787 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.18 
 
 		 776 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  47.09 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.97 
 
 		 797 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.69 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.5 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.19 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  44.12 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.61 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  43.99 
 
 		 475 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  44.08 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  44.29 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  45.69 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  45.86 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  41.52 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  44.26 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.9 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  46.78 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  42.18 
 
 		 777 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.68 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  46.86 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  46.04 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.27 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  43.83 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  43.88 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  41.26 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  43.37 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  41.88 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  45.66 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  44.6 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  44.12 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.07 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  43.27 
 
 		 523 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  46.86 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.88 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  42.02 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.09 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  46.14 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.29 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  46.3 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  46.03 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  46.25 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  45.73 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.88 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.46 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  41.63 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  41.63 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  42.11 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  42.25 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  47.17 
 
 		 500 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.32 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  45.25 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  46.04 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  46.04 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  46.04 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  46.04 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  42.27 
 
 		 534 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  46.5 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  45.93 
 
 		 585 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.25 
 
 		 536 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.33 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  45.71 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  44.2 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  45.1 
 
 		 481 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  45.15 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  40.74 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.11 
 
 		 490 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.76 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  44.22 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  41.47 
 
 		 526 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  42.12 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  45.05 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  45.33 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  45.66 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  43.48 
 
 		 534 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  45.77 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  44.2 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.34 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.08 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  42.72 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.74 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  44.91 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.67 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>