More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2744 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
512 aa  1010    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  65.33 
 
 
521 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  64.06 
 
 
575 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  63.1 
 
 
509 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  60.91 
 
 
509 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  60.32 
 
 
501 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  58.76 
 
 
511 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  61.4 
 
 
495 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  61.4 
 
 
495 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  61.4 
 
 
495 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  54.51 
 
 
529 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  58.99 
 
 
509 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  57.86 
 
 
498 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  56.33 
 
 
486 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  56.66 
 
 
495 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  53.67 
 
 
517 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  54.9 
 
 
491 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  58.01 
 
 
508 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  56.89 
 
 
527 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  54.36 
 
 
520 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  54.62 
 
 
490 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  54 
 
 
507 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  55.01 
 
 
494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.44 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  53.15 
 
 
476 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  54.03 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.68 
 
 
506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.49 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.15 
 
 
500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.68 
 
 
506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.29 
 
 
513 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.29 
 
 
506 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  49.1 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  47.88 
 
 
487 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  45.52 
 
 
536 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  47.79 
 
 
495 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  49.29 
 
 
495 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  45.1 
 
 
475 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  48.5 
 
 
490 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  47.12 
 
 
489 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  44.9 
 
 
484 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  48.99 
 
 
498 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  48.98 
 
 
481 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  49.2 
 
 
485 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  48.1 
 
 
496 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  47.06 
 
 
484 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  47.53 
 
 
486 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  44.04 
 
 
485 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  44.38 
 
 
508 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  44.51 
 
 
485 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  46.37 
 
 
484 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  47.33 
 
 
486 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 
494 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  48.91 
 
 
501 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  46.57 
 
 
484 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  45.01 
 
 
483 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  43.87 
 
 
541 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  44.92 
 
 
534 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  48.19 
 
 
481 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  43.65 
 
 
560 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.5 
 
 
503 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  48.39 
 
 
481 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.49 
 
 
503 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  43.95 
 
 
541 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  43.57 
 
 
541 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  45.42 
 
 
502 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  46.08 
 
 
484 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  39.96 
 
 
507 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  49.6 
 
 
511 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  48.07 
 
 
483 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  48.81 
 
 
500 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  43.34 
 
 
556 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.52 
 
 
514 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  43.67 
 
 
565 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  48.81 
 
 
500 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.44 
 
 
503 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.15 
 
 
506 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  43.14 
 
 
514 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  41.76 
 
 
515 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  47.18 
 
 
488 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  45.85 
 
 
518 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  41.95 
 
 
501 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  43.18 
 
 
526 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  43.02 
 
 
523 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  46.85 
 
 
511 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  47.42 
 
 
488 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  42.13 
 
 
534 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  42.25 
 
 
554 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  39.74 
 
 
513 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  48.3 
 
 
505 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  42.89 
 
 
503 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.41 
 
 
514 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  45.27 
 
 
485 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.28 
 
 
787 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  43.06 
 
 
864 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  46.29 
 
 
485 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.33 
 
 
517 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  46.49 
 
 
493 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  48.31 
 
 
511 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  45.44 
 
 
490 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>