More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2051 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  100 
 
 
495 aa  978    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  100 
 
 
495 aa  978    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  100 
 
 
495 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  66.2 
 
 
509 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  61.78 
 
 
517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  61.31 
 
 
575 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  61.82 
 
 
512 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  60.32 
 
 
521 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  60.99 
 
 
509 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  60.57 
 
 
507 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  60.49 
 
 
501 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  58.57 
 
 
511 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  58.32 
 
 
509 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  55.71 
 
 
486 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  55.06 
 
 
498 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  59.76 
 
 
508 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  51.96 
 
 
529 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  56.64 
 
 
520 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  54.81 
 
 
495 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  54.6 
 
 
527 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  53.13 
 
 
491 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  53.33 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  52.11 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  52.16 
 
 
476 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.03 
 
 
499 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  52.31 
 
 
501 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.66 
 
 
506 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.66 
 
 
506 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.27 
 
 
506 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.04 
 
 
491 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.27 
 
 
506 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.07 
 
 
513 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  43.26 
 
 
491 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.87 
 
 
481 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.49 
 
 
514 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.9 
 
 
484 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  45.34 
 
 
487 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.87 
 
 
481 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  41.67 
 
 
491 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  45.51 
 
 
495 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.55 
 
 
536 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.74 
 
 
500 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  38.27 
 
 
513 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.16 
 
 
485 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.33 
 
 
787 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  39.38 
 
 
506 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  44.13 
 
 
485 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  43.71 
 
 
483 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  47.6 
 
 
501 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  39.76 
 
 
488 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  40.28 
 
 
514 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.13 
 
 
475 aa  365  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.45 
 
 
503 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  45.23 
 
 
489 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  48.28 
 
 
495 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  48.39 
 
 
488 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  42 
 
 
495 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  47.9 
 
 
500 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  47.6 
 
 
511 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.9 
 
 
494 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  46.59 
 
 
485 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  37.96 
 
 
507 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  45.96 
 
 
496 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  41.3 
 
 
541 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.52 
 
 
494 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.15 
 
 
863 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.36 
 
 
510 aa  360  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  47.12 
 
 
504 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.89 
 
 
490 aa  359  6e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  47.54 
 
 
481 aa  359  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  42.08 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.1 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  47.8 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  41.38 
 
 
541 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.71 
 
 
864 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  41.38 
 
 
485 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  43.42 
 
 
858 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  41.17 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  41.4 
 
 
556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  47.7 
 
 
511 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  41 
 
 
541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  47.7 
 
 
511 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  45.44 
 
 
484 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.21 
 
 
517 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.15 
 
 
560 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  41.21 
 
 
565 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  40.95 
 
 
526 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  39.34 
 
 
515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.64 
 
 
508 aa  354  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  46.34 
 
 
498 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  45.71 
 
 
483 aa  353  4e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  40.5 
 
 
523 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.35 
 
 
776 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.47 
 
 
485 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  46.35 
 
 
483 aa  352  7e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  46.87 
 
 
500 aa  352  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  40.12 
 
 
501 aa  352  7e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  43.7 
 
 
481 aa  352  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.62 
 
 
484 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  47.18 
 
 
520 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>