More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1999 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  66.46 
 
 		 487 aa  638    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  100 
 
 		 492 aa  983    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  66.25 
 
 		 480 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  61.32 
 
 		 478 aa  598  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  54.49 
 
 		 490 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  51.98 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  52.59 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.2 
 
 		 776 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.43 
 
 		 797 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.22 
 
 		 772 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  44.64 
 
 		 787 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.67 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.16 
 
 		 777 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  46.84 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 491 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  43.35 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  41.75 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.27 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  42.57 
 
 		 491 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.06 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  45.15 
 
 		 515 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.55 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  48.88 
 
 		 498 aa  360  3e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  41.53 
 
 		 494 aa  359  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.93 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  42.23 
 
 		 507 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  41.12 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  44.96 
 
 		 517 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  41.12 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  47.86 
 
 		 518 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.16 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.44 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.46 
 
 		 514 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.55 
 
 		 508 aa  353  5.9999999999999994e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  44.14 
 
 		 493 aa  352  7e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  41.25 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  44.47 
 
 		 498 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  44.22 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  41.73 
 
 		 512 aa  350  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  42.4 
 
 		 514 aa  349  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  42.48 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  43.74 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  40.81 
 
 		 506 aa  347  4e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  43.98 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  45.36 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  41.45 
 
 		 498 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 485 aa  343  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.85 
 
 		 500 aa  343  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  45.57 
 
 		 498 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  36 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  37.7 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  36.04 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  35.53 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  43.16 
 
 		 517 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  40.32 
 
 		 496 aa  340  5e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  46.36 
 
 		 509 aa  338  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  40.79 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  40.21 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  39.64 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  41.28 
 
 		 483 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  42.86 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  43.96 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  35.91 
 
 		 495 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44.92 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.15 
 
 		 485 aa  336  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  44.33 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  44.93 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  41.55 
 
 		 506 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  43.2 
 
 		 545 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.27 
 
 		 484 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  39.63 
 
 		 487 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 503 aa  332  8e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 535 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 512 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  45.07 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  34.97 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 531 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  41.2 
 
 		 560 aa  332  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  43.26 
 
 		 481 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  43.46 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  36.9 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  40.61 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  39.63 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  44.33 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  42.28 
 
 		 481 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 585 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  43.46 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  43.17 
 
 		 495 aa  329  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 491 aa  329  9e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>