266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1259 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  100 
 
 
509 aa  1032    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  83.89 
 
 
509 aa  886    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  86.06 
 
 
495 aa  882    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  77.06 
 
 
510 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  59.24 
 
 
504 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  59.15 
 
 
494 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  51.59 
 
 
496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  52.3 
 
 
506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  51 
 
 
498 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  53.54 
 
 
494 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  47.49 
 
 
491 aa  487  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  45.98 
 
 
491 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  46.39 
 
 
502 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  46.28 
 
 
491 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  46.89 
 
 
488 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  45.07 
 
 
495 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  45.07 
 
 
495 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  45.42 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  41.35 
 
 
494 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.16 
 
 
503 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  38.99 
 
 
506 aa  363  4e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  39.96 
 
 
517 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  38.95 
 
 
777 aa  359  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.23 
 
 
797 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.17 
 
 
503 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  37.7 
 
 
515 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  39.91 
 
 
490 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  40.66 
 
 
489 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  39.25 
 
 
490 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  38.49 
 
 
532 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  36.36 
 
 
496 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  36.58 
 
 
514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  38.77 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  37.92 
 
 
503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  38.68 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  37.11 
 
 
772 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  37.25 
 
 
776 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  36.13 
 
 
514 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  37.36 
 
 
787 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  34.77 
 
 
492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  36.51 
 
 
487 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  37.4 
 
 
512 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.45 
 
 
501 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  38.58 
 
 
863 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  38.91 
 
 
491 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  37.25 
 
 
490 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  35.98 
 
 
511 aa  316  5e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  37.72 
 
 
498 aa  315  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  34.46 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  35.93 
 
 
490 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  36.09 
 
 
852 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  34.68 
 
 
495 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  35 
 
 
864 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  36.13 
 
 
493 aa  312  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  35.06 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  34.86 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  35.18 
 
 
484 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  36.27 
 
 
485 aa  310  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  36.71 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  35.53 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  36.22 
 
 
863 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  36.8 
 
 
513 aa  307  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  33.53 
 
 
498 aa  305  9.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  34.17 
 
 
556 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  34.36 
 
 
526 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  36.2 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  33.4 
 
 
541 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  38.05 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  33.14 
 
 
541 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  35.52 
 
 
507 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  33.98 
 
 
565 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  35.55 
 
 
505 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  34.38 
 
 
506 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  35.66 
 
 
484 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  35.16 
 
 
506 aa  302  9e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  32.34 
 
 
539 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  33.85 
 
 
560 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  35.18 
 
 
480 aa  302  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  34.44 
 
 
504 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  34.38 
 
 
506 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  35.86 
 
 
484 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  34.58 
 
 
506 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  34.18 
 
 
513 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  35.24 
 
 
484 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  36.94 
 
 
503 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  33.87 
 
 
510 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  33.14 
 
 
541 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  34.91 
 
 
500 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  35.87 
 
 
484 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  35.12 
 
 
483 aa  299  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  33.99 
 
 
506 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  34.83 
 
 
508 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  36.46 
 
 
486 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  34.84 
 
 
488 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  34.18 
 
 
858 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  34.92 
 
 
506 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  35.64 
 
 
483 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  36.96 
 
 
485 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  35.38 
 
 
491 aa  297  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  34.27 
 
 
536 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>