263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13271 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  77.06 
 
 
509 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  78.24 
 
 
509 aa  812    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  80.44 
 
 
495 aa  810    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  100 
 
 
510 aa  1033    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  59.29 
 
 
504 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  58.75 
 
 
494 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  51.79 
 
 
496 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  53.69 
 
 
506 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  50.5 
 
 
498 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  54.27 
 
 
494 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  46.09 
 
 
491 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  47.38 
 
 
491 aa  474  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  45.02 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  48.4 
 
 
488 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  46.37 
 
 
495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  46.52 
 
 
495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  46.37 
 
 
495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.98 
 
 
491 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  40.2 
 
 
494 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.31 
 
 
503 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.74 
 
 
506 aa  359  8e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  41.79 
 
 
503 aa  353  4e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  40.61 
 
 
489 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.54 
 
 
797 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  39.58 
 
 
515 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  39.48 
 
 
503 aa  346  7e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  39.96 
 
 
490 aa  346  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  37.08 
 
 
514 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  39.19 
 
 
490 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  40.41 
 
 
777 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  38.48 
 
 
517 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  38.4 
 
 
787 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  37.4 
 
 
503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  35.45 
 
 
496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  38.22 
 
 
532 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  40.09 
 
 
485 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  36.36 
 
 
772 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  36.44 
 
 
776 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  39.3 
 
 
512 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  38.19 
 
 
487 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  35.66 
 
 
511 aa  323  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  35.8 
 
 
514 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  37.74 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  36.85 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  36.85 
 
 
490 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  34.52 
 
 
492 aa  319  9e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  38.39 
 
 
491 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.94 
 
 
494 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  36.38 
 
 
485 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  36.63 
 
 
505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  37.74 
 
 
863 aa  312  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  36.15 
 
 
506 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  36.95 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.74 
 
 
513 aa  310  4e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  37.62 
 
 
501 aa  309  8e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  34.59 
 
 
495 aa  309  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  35.01 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  35.47 
 
 
493 aa  307  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  35.38 
 
 
852 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  36.35 
 
 
484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  36.64 
 
 
484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  36.55 
 
 
484 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  37.97 
 
 
507 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  35.55 
 
 
498 aa  302  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  38.85 
 
 
485 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  35.07 
 
 
484 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  38.05 
 
 
560 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  34.92 
 
 
506 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  35.42 
 
 
478 aa  300  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  35.19 
 
 
863 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  31.41 
 
 
539 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  32.86 
 
 
509 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  35.31 
 
 
507 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  38.9 
 
 
534 aa  300  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  34.93 
 
 
483 aa  300  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  36.18 
 
 
498 aa  300  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  34.18 
 
 
479 aa  299  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  34.09 
 
 
541 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  33.47 
 
 
510 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  35.36 
 
 
536 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  34.09 
 
 
541 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  34.18 
 
 
500 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  35.48 
 
 
483 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  35.37 
 
 
864 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  34.52 
 
 
481 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  33.2 
 
 
485 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  35.73 
 
 
486 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  36.72 
 
 
494 aa  296  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  33.66 
 
 
508 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  32.69 
 
 
518 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  35.6 
 
 
483 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  33.79 
 
 
504 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  34.29 
 
 
565 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  38.41 
 
 
487 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  33.99 
 
 
500 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  37.55 
 
 
487 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  34.36 
 
 
560 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  33.9 
 
 
541 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  34.1 
 
 
556 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  37.65 
 
 
514 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>