More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3692 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 484 aa  967    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.94 
 
 		 514 aa  360  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  46.65 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  45.93 
 
 		 490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.66 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  41.68 
 
 		 511 aa  353  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  39.45 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  42.11 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  40.74 
 
 		 505 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.49 
 
 		 491 aa  336  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  39.8 
 
 		 515 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  39.72 
 
 		 517 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  37.55 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  41.52 
 
 		 863 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  41.46 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  37.35 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  41.92 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  43.67 
 
 		 489 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  46.09 
 
 		 479 aa  329  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.04 
 
 		 513 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  40.65 
 
 		 503 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  40.57 
 
 		 491 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  39.28 
 
 		 503 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  39.68 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  38.9 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  44.24 
 
 		 491 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  37.35 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  38.88 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  36.67 
 
 		 501 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  40.55 
 
 		 508 aa  320  3.9999999999999996e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  38.48 
 
 		 506 aa  319  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  38.68 
 
 		 506 aa  319  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  37.65 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  38.48 
 
 		 506 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  35.87 
 
 		 507 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  39.01 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.92 
 
 		 863 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  38.52 
 
 		 485 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  40.4 
 
 		 495 aa  316  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  41.8 
 
 		 496 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  38.79 
 
 		 864 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  38.87 
 
 		 495 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  38.87 
 
 		 495 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  38.28 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  37.35 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.63 
 
 		 797 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  45.95 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  36.13 
 
 		 514 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  38.96 
 
 		 502 aa  312  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  38.54 
 
 		 512 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  40.73 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  38.54 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.86 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  42.54 
 
 		 509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  34.73 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  45.74 
 
 		 628 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  39.59 
 
 		 534 aa  310  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.7 
 
 		 508 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  38.6 
 
 		 490 aa  309  8e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  41.7 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  35.01 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  36.02 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  44.74 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  41.29 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  40.04 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  42.37 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 541 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.05 
 
 		 521 aa  306  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  38.71 
 
 		 498 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  39.63 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  41.96 
 
 		 954 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  41.16 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  36.91 
 
 		 787 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  41.03 
 
 		 495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  36.88 
 
 		 541 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  38.69 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  37.33 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  37.7 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  36.94 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  41.54 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  37.45 
 
 		 475 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  36.36 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  36.2 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  35.87 
 
 		 509 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  37.37 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  36.01 
 
 		 556 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  36.2 
 
 		 534 aa  299  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  37.01 
 
 		 777 aa  299  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  36.58 
 
 		 527 aa  299  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  36.25 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  36.44 
 
 		 494 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  35.01 
 
 		 495 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  41.52 
 
 		 496 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.57 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  39.88 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>