297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2304 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  72.85 
 
 
513 aa  675    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  100 
 
 
508 aa  1010    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  66.6 
 
 
479 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  63.14 
 
 
507 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  62.45 
 
 
485 aa  601  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  64.61 
 
 
493 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  64.33 
 
 
496 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  65.3 
 
 
492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  61.16 
 
 
494 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  65.84 
 
 
628 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2806  cobyric acid synthase CobQ  60.66 
 
 
501 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563114  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0518  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  58.46 
 
 
503 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00186499  normal  0.0297746 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  52.31 
 
 
465 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.17 
 
 
514 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 
521 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.74 
 
 
513 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.83 
 
 
506 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  45.16 
 
 
509 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.95 
 
 
506 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.74 
 
 
506 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.52 
 
 
506 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  38.51 
 
 
513 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  45.81 
 
 
575 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  43.65 
 
 
476 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.58 
 
 
490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  45.58 
 
 
483 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  44.59 
 
 
511 aa  333  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.59 
 
 
490 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  41.84 
 
 
529 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  40.46 
 
 
517 aa  332  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  45.79 
 
 
501 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  40.73 
 
 
864 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  44.2 
 
 
498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  42.77 
 
 
484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.31 
 
 
494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  41.36 
 
 
511 aa  326  6e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  44.07 
 
 
485 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  40.28 
 
 
503 aa  326  7e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  42.38 
 
 
484 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  40.36 
 
 
506 aa  324  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.14 
 
 
500 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  43.51 
 
 
527 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  44 
 
 
494 aa  323  5e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  44.87 
 
 
509 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  42.18 
 
 
484 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  42.29 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.16 
 
 
503 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.45 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  42.29 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  45.16 
 
 
508 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  41.98 
 
 
514 aa  320  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  40.52 
 
 
489 aa  319  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  41.9 
 
 
486 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.59 
 
 
501 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  42.69 
 
 
491 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  41.63 
 
 
863 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.75 
 
 
490 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.86 
 
 
502 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  38.89 
 
 
485 aa  316  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  41.49 
 
 
534 aa  316  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  45.16 
 
 
483 aa  316  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  43.31 
 
 
539 aa  316  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  42.97 
 
 
490 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  41.39 
 
 
493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.65 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  41.08 
 
 
507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  37.85 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  41.7 
 
 
484 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  39.92 
 
 
491 aa  312  7.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  43.08 
 
 
495 aa  312  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  42.17 
 
 
481 aa  312  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  42.98 
 
 
487 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  36.97 
 
 
507 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.19 
 
 
499 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  38.49 
 
 
787 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.74 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.77 
 
 
797 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  41.48 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  39.92 
 
 
495 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  39.92 
 
 
495 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  40.27 
 
 
503 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  39.36 
 
 
541 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  38.99 
 
 
858 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  39.15 
 
 
500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  39.45 
 
 
503 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  38.4 
 
 
772 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  38.98 
 
 
541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  41.16 
 
 
491 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  42.39 
 
 
518 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  39.44 
 
 
534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  42.38 
 
 
495 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  37.22 
 
 
536 aa  306  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  41.54 
 
 
486 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  38.68 
 
 
541 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  42.38 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  38.93 
 
 
560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  36.92 
 
 
487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  39.74 
 
 
515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  42.14 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>