More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2806 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  73.64 
 
 		 492 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  71.6 
 
 		 496 aa  668    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2806  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 501 aa  1004    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563114  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  72.61 
 
 		 493 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  68.42 
 
 		 479 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  73.6 
 
 		 628 aa  611  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  64.52 
 
 		 507 aa  608  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  65.16 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  65.28 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  60.61 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  60.2 
 
 		 513 aa  511  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  52.61 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0518  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.33 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00186499  normal  0.0297746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  46.44 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.51 
 
 		 503 aa  339  7e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  41.63 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  46.81 
 
 		 521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  46.58 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  41.58 
 
 		 503 aa  336  7e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  46.29 
 
 		 575 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.54 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.78 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.75 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.61 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  46.58 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  45.45 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  42.8 
 
 		 797 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  46.51 
 
 		 527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.38 
 
 		 513 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.74 
 
 		 506 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  40.04 
 
 		 514 aa  323  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.96 
 
 		 513 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  41.23 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  40.62 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  44.3 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  42.52 
 
 		 495 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.01 
 
 		 490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.29 
 
 		 489 aa  319  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.44 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  41.48 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.7 
 
 		 502 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  38.12 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  43.57 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  41.11 
 
 		 858 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  44.84 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  42.58 
 
 		 494 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  41.43 
 
 		 491 aa  313  6.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  41.42 
 
 		 529 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  42.13 
 
 		 863 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.95 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  38.61 
 
 		 864 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  40.22 
 
 		 515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  40.87 
 
 		 511 aa  309  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.91 
 
 		 863 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  43.25 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  40.13 
 
 		 532 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  45.76 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.11 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 483 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  41.81 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  43.99 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  42.48 
 
 		 483 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  42.98 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  43.45 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  41.53 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  41.59 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  41.59 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  39.5 
 
 		 787 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  35.46 
 
 		 494 aa  299  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.45 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  44.06 
 
 		 495 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  42.76 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  36.06 
 
 		 487 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  38.01 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 481 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  35.84 
 
 		 487 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  42.14 
 
 		 852 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.49 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  39.61 
 
 		 772 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  39.96 
 
 		 483 aa  294  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  39.26 
 
 		 495 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  39.04 
 
 		 560 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  41.4 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  42.26 
 
 		 486 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  39.75 
 
 		 506 aa  292  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  42.39 
 
 		 485 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.52 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  39.18 
 
 		 776 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  43.07 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  42.79 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  41.92 
 
 		 484 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  42.36 
 
 		 490 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  41.09 
 
 		 486 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>