More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2874 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 465 aa  923    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  54.98 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  49.5 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  51.98 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  56.12 
 
 		 493 aa  425  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  51.65 
 
 		 494 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  52.54 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  53.2 
 
 		 492 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2806  cobyric acid synthase CobQ  52.82 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563114  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.75 
 
 		 508 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  56.23 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  49.9 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.52 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.22 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  47.06 
 
 		 858 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.06 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  46.31 
 
 		 863 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  47.95 
 
 		 863 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.86 
 
 		 506 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.86 
 
 		 513 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.46 
 
 		 506 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.42 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.66 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  41.82 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  39.57 
 
 		 513 aa  358  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  46.09 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  40.52 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  44.08 
 
 		 864 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  41.46 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  44.73 
 
 		 508 aa  353  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  46.5 
 
 		 491 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  45.16 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  46.37 
 
 		 502 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  44.94 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  46.78 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  42.57 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.75 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.35 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.83 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  47.15 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  50.56 
 
 		 496 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  48.07 
 
 		 509 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  38.02 
 
 		 487 aa  339  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.46 
 
 		 514 aa  339  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  44.38 
 
 		 551 aa  338  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.62 
 
 		 485 aa  338  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  46.84 
 
 		 498 aa  338  9e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  38.02 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.47 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  41.82 
 
 		 491 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  48.21 
 
 		 521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  47.57 
 
 		 495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  43.06 
 
 		 491 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  41.49 
 
 		 495 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  41.49 
 
 		 495 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  45.49 
 
 		 852 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.62 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  45.67 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  47.59 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.25 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.74 
 
 		 500 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  44.69 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  46.53 
 
 		 494 aa  333  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.66 
 
 		 484 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.97 
 
 		 490 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.09 
 
 		 489 aa  332  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  46.07 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  45.47 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  40.4 
 
 		 772 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.47 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  45.17 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  45.66 
 
 		 507 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  42.13 
 
 		 512 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  46.04 
 
 		 483 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.41 
 
 		 776 aa  329  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  42.67 
 
 		 539 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  37.68 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  45.39 
 
 		 484 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  39.53 
 
 		 560 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.59 
 
 		 511 aa  326  6e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  38 
 
 		 507 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  44.47 
 
 		 561 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  46.44 
 
 		 476 aa  325  8.000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  47.1 
 
 		 498 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  40.32 
 
 		 787 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  40.17 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.04 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  45.15 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  46.53 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  48.11 
 
 		 575 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 484 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  46.43 
 
 		 490 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  41.3 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  44.19 
 
 		 500 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  43.01 
 
 		 485 aa  322  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  44.54 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  42.59 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>