More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2529 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 496 aa  994    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2806  cobyric acid synthase CobQ  70.99 
 
 		 501 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563114  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  72.84 
 
 		 485 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  72.91 
 
 		 494 aa  715    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  81.26 
 
 		 492 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  70.7 
 
 		 507 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  76.47 
 
 		 479 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  78.38 
 
 		 628 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  92.71 
 
 		 493 aa  903    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  66.4 
 
 		 513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  64.33 
 
 		 508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0518  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  55.84 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00186499  normal  0.0297746 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  54.55 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.47 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.97 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.37 
 
 		 491 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  46.88 
 
 		 521 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 476 aa  339  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  43.22 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  39.37 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  45.81 
 
 		 527 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.92 
 
 		 506 aa  334  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.43 
 
 		 506 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.22 
 
 		 506 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  40.17 
 
 		 514 aa  332  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.33 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  41.79 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  42.52 
 
 		 483 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  45.04 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  41.79 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  45.26 
 
 		 575 aa  329  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  42.44 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 498 aa  326  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  44.85 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  46.1 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  40.86 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  45.05 
 
 		 509 aa  323  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  44.78 
 
 		 863 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  40.89 
 
 		 858 aa  321  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  41.74 
 
 		 514 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  45.95 
 
 		 484 aa  319  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  38.84 
 
 		 501 aa  319  7.999999999999999e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.31 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  42.47 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.13 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.55 
 
 		 864 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  45.34 
 
 		 490 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.62 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  40.99 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  43.93 
 
 		 491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  40.99 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  43.5 
 
 		 491 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  42.83 
 
 		 852 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  42.31 
 
 		 495 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  43.51 
 
 		 491 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  43.66 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  43.75 
 
 		 551 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.01 
 
 		 863 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  40.72 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  40.62 
 
 		 797 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.2 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  42.47 
 
 		 539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  39.13 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  36.24 
 
 		 487 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  42.76 
 
 		 486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  42.26 
 
 		 484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  42.35 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  36.72 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  41.72 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 518 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.21 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  48.19 
 
 		 501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  40.62 
 
 		 512 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  40.91 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  42.24 
 
 		 954 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  38.29 
 
 		 490 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  38.12 
 
 		 526 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  39.2 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  39.17 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  42.7 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  39.17 
 
 		 565 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  44.02 
 
 		 512 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  41.61 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  39.61 
 
 		 488 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  40.46 
 
 		 508 aa  300  6e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  38.54 
 
 		 556 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  39.87 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  37.48 
 
 		 534 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  37.9 
 
 		 560 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  40 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  43.1 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  40.92 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  39.96 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  42.86 
 
 		 511 aa  297  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 481 aa  297  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  34.96 
 
 		 509 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  42.12 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>