More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0061 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
954 aa  1893    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  41.78 
 
 
506 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.77 
 
 
503 aa  373  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  41.25 
 
 
503 aa  373  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.76 
 
 
495 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  44.02 
 
 
491 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.42 
 
 
797 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 
494 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.89 
 
 
517 aa  365  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  39.64 
 
 
494 aa  365  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  42.8 
 
 
491 aa  362  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  43.87 
 
 
493 aa  359  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.57 
 
 
506 aa  358  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  42.77 
 
 
515 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.37 
 
 
506 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.17 
 
 
513 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  42.21 
 
 
503 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.56 
 
 
501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  42.16 
 
 
488 aa  355  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  46.26 
 
 
496 aa  354  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.17 
 
 
506 aa  354  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.08 
 
 
772 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  40.85 
 
 
495 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  46.04 
 
 
490 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  42.19 
 
 
514 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 
502 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  40.92 
 
 
507 aa  353  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.09 
 
 
776 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  40.85 
 
 
495 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  40.32 
 
 
514 aa  352  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  41.97 
 
 
506 aa  352  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.08 
 
 
491 aa  352  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.32 
 
 
511 aa  351  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  45.44 
 
 
490 aa  350  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  38.23 
 
 
487 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.6 
 
 
514 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  42.86 
 
 
532 aa  347  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  38.08 
 
 
487 aa  347  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  43.36 
 
 
495 aa  347  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.64 
 
 
513 aa  347  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  41.57 
 
 
534 aa  346  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.8 
 
 
490 aa  346  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.48 
 
 
503 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.07 
 
 
787 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  47.02 
 
 
490 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  42.74 
 
 
487 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  41.7 
 
 
505 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  47.38 
 
 
490 aa  343  9e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  40.53 
 
 
485 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  44.38 
 
 
508 aa  341  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  43.12 
 
 
485 aa  340  8e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.19 
 
 
485 aa  340  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.95 
 
 
486 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  42.54 
 
 
484 aa  338  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  44.17 
 
 
486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.93 
 
 
509 aa  338  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  41.72 
 
 
485 aa  337  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.37 
 
 
489 aa  337  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.03 
 
 
485 aa  336  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  42.69 
 
 
479 aa  336  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  44.72 
 
 
492 aa  335  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  41.81 
 
 
506 aa  335  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40.96 
 
 
536 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  43.18 
 
 
489 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  39.55 
 
 
777 aa  334  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.41 
 
 
484 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  43.49 
 
 
551 aa  332  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  39.96 
 
 
560 aa  331  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  43.89 
 
 
495 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  46.97 
 
 
491 aa  330  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  40.74 
 
 
475 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  40.43 
 
 
863 aa  330  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  41.52 
 
 
518 aa  330  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  40.91 
 
 
512 aa  330  7e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  44.75 
 
 
495 aa  330  7e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.2 
 
 
484 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.9 
 
 
484 aa  330  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  39.66 
 
 
565 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  42.36 
 
 
484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  39.89 
 
 
556 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  44.13 
 
 
483 aa  329  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  39.44 
 
 
526 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
534 aa  327  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  40.95 
 
 
864 aa  327  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  40.85 
 
 
529 aa  327  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
560 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  40.9 
 
 
503 aa  326  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.41 
 
 
484 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  42.94 
 
 
476 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  45.05 
 
 
488 aa  325  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  43.63 
 
 
507 aa  325  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  40 
 
 
541 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  40.52 
 
 
495 aa  324  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  41.18 
 
 
496 aa  324  5e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  46.09 
 
 
520 aa  324  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.31 
 
 
507 aa  324  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  43.34 
 
 
491 aa  324  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  40.12 
 
 
541 aa  323  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  39.81 
 
 
541 aa  323  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  38.8 
 
 
554 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>