287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1596 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  100 
 
 
496 aa  1005    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  76.16 
 
 
498 aa  756    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  67.79 
 
 
506 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  56.8 
 
 
504 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  56.02 
 
 
494 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  57.83 
 
 
494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  51.09 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  51.59 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  51.79 
 
 
510 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  51.5 
 
 
495 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  52.72 
 
 
502 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  49.7 
 
 
488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  50.6 
 
 
491 aa  514  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  52.02 
 
 
491 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  50.8 
 
 
491 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  49.3 
 
 
495 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  49.3 
 
 
495 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  49.5 
 
 
495 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.18 
 
 
494 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.45 
 
 
503 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  43.64 
 
 
487 aa  359  8e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  40.48 
 
 
515 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  38.87 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.86 
 
 
863 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  40.86 
 
 
777 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  38.61 
 
 
503 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.08 
 
 
501 aa  349  7e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  43.06 
 
 
863 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  41.4 
 
 
539 aa  347  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  39.88 
 
 
490 aa  346  5e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  38.13 
 
 
507 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  40.32 
 
 
864 aa  343  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  40.39 
 
 
797 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  38.37 
 
 
503 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  40.91 
 
 
518 aa  339  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.16 
 
 
513 aa  339  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  41.21 
 
 
852 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  40 
 
 
517 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  40.52 
 
 
514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  38.75 
 
 
787 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  39.41 
 
 
776 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  41.43 
 
 
481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  40.32 
 
 
492 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.99 
 
 
500 aa  336  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  39.21 
 
 
772 aa  336  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  40.39 
 
 
532 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  40.68 
 
 
478 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  39.02 
 
 
503 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  40.43 
 
 
496 aa  332  8e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  40.37 
 
 
490 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  37.8 
 
 
514 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  39.49 
 
 
512 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.25 
 
 
514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  40.35 
 
 
483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  38.23 
 
 
475 aa  326  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  34.26 
 
 
494 aa  325  8.000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  39.72 
 
 
506 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  38.37 
 
 
485 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  41.83 
 
 
481 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  41.2 
 
 
490 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  41.63 
 
 
481 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  39.53 
 
 
506 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  39.53 
 
 
506 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  38.35 
 
 
485 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  41.63 
 
 
491 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  39.53 
 
 
506 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  41.32 
 
 
489 aa  323  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  39.25 
 
 
513 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  41.55 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  40.12 
 
 
508 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  41.82 
 
 
495 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  40.49 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  40.61 
 
 
484 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  40.94 
 
 
485 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  41.72 
 
 
490 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  40.04 
 
 
483 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  39.45 
 
 
534 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  37.45 
 
 
485 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  40.81 
 
 
484 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  41.02 
 
 
484 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  41 
 
 
488 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  39.84 
 
 
506 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  38.93 
 
 
484 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.34 
 
 
521 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  37.5 
 
 
536 aa  316  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  41.8 
 
 
484 aa  316  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  42.25 
 
 
486 aa  316  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  40.8 
 
 
500 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  40.57 
 
 
486 aa  316  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  41.08 
 
 
486 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  38.29 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  38.22 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  39.29 
 
 
498 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  37.18 
 
 
511 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  40.6 
 
 
500 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  39.71 
 
 
483 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  40.51 
 
 
509 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  35.21 
 
 
487 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  37.72 
 
 
560 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  41.85 
 
 
482 aa  310  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>