More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0375 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  100 
 
 		 492 aa  995    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0530  cobyric acid synthase  81.26 
 
 		 491 aa  806    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.479348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  93.5 
 
 		 492 aa  945    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0462  cobyric acid synthase  92.07 
 
 		 492 aa  914    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0586994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1252  cobyric acid synthase  69.72 
 
 		 493 aa  672    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.49 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  41.47 
 
 		 772 aa  362  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.2 
 
 		 776 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  40.28 
 
 		 787 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  40.76 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.72 
 
 		 797 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.72 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  40.72 
 
 		 532 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  38.95 
 
 		 491 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  38.23 
 
 		 491 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  40.35 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  38.66 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  37.82 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  37.82 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  37.63 
 
 		 491 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  38.05 
 
 		 517 aa  336  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  39 
 
 		 506 aa  335  9e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  39.68 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  39.8 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  40.77 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  37.97 
 
 		 495 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  40.48 
 
 		 495 aa  332  9e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  37.97 
 
 		 502 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  37.53 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  37.73 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.53 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  37.52 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  37.7 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  37.33 
 
 		 506 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  37.33 
 
 		 513 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  39.55 
 
 		 480 aa  325  9e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  37.33 
 
 		 506 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  37.33 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  39.72 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  36.9 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  39.11 
 
 		 487 aa  323  5e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  37.97 
 
 		 503 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  38.02 
 
 		 777 aa  323  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  37.1 
 
 		 515 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  37.4 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  38.31 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  36.24 
 
 		 541 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  36.26 
 
 		 541 aa  320  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  37.8 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  37.9 
 
 		 487 aa  319  7e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  36.59 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  36.03 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  36.25 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  37.14 
 
 		 489 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  37.6 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  35.83 
 
 		 490 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  38.85 
 
 		 505 aa  316  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  36.29 
 
 		 509 aa  315  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  36.71 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  36.8 
 
 		 501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  35.85 
 
 		 541 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  38.31 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  36.86 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  36.29 
 
 		 499 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  33.86 
 
 		 507 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  35.64 
 
 		 495 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  37.38 
 
 		 509 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  36.09 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  36.93 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  35.77 
 
 		 565 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  35.69 
 
 		 536 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  35.43 
 
 		 514 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  36.03 
 
 		 514 aa  310  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  35.83 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.48 
 
 		 513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  35.45 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  35.45 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  35.19 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  36.93 
 
 		 496 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  35 
 
 		 526 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  34.74 
 
 		 864 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  35.55 
 
 		 510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  36.92 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  34.67 
 
 		 863 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  35.69 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  36.42 
 
 		 498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  36.16 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  37.23 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  36.38 
 
 		 560 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  36.16 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  34.67 
 
 		 493 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  36.46 
 
 		 488 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  34.21 
 
 		 554 aa  302  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  34.26 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  36.74 
 
 		 534 aa  302  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  35.9 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  35.61 
 
 		 512 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  36 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  35.81 
 
 		 494 aa  300  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>