277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2504 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  100 
 
 
520 aa  1030    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  65.54 
 
 
498 aa  632  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  63.65 
 
 
518 aa  609  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  58.92 
 
 
538 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  57.45 
 
 
563 aa  559  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  43.98 
 
 
485 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.8 
 
 
490 aa  365  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  44.77 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  45.92 
 
 
492 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  40.87 
 
 
787 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  41.44 
 
 
491 aa  332  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  41.86 
 
 
494 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  39.69 
 
 
503 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  41.09 
 
 
532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  40.53 
 
 
777 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  40.89 
 
 
772 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  41.87 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  41.75 
 
 
487 aa  327  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  39.31 
 
 
491 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  41.68 
 
 
797 aa  326  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  40.45 
 
 
491 aa  325  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  40.47 
 
 
776 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  40.08 
 
 
506 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  39.89 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  39.89 
 
 
513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  39.51 
 
 
506 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  39.46 
 
 
502 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  39.7 
 
 
506 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  38.86 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  38.04 
 
 
488 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  42.07 
 
 
480 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  36.59 
 
 
513 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  43.02 
 
 
496 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  37.83 
 
 
515 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  40.04 
 
 
493 aa  309  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  40.37 
 
 
514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  40.59 
 
 
503 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  45.12 
 
 
509 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  38.76 
 
 
503 aa  305  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  45.9 
 
 
512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  36.64 
 
 
507 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  37.19 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  36.14 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  36.14 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  40.12 
 
 
517 aa  303  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  39.36 
 
 
560 aa  302  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.31 
 
 
494 aa  300  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  41.35 
 
 
518 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  38.42 
 
 
503 aa  298  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  42 
 
 
490 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  43.89 
 
 
509 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  41.51 
 
 
490 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  37.13 
 
 
489 aa  296  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.67 
 
 
501 aa  295  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  43.53 
 
 
529 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  40.16 
 
 
508 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  36.94 
 
 
506 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.3 
 
 
521 aa  292  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  35.59 
 
 
487 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  42.5 
 
 
486 aa  292  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  38.83 
 
 
490 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  35.04 
 
 
487 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  40.43 
 
 
490 aa  290  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  38.15 
 
 
483 aa  289  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  42.14 
 
 
479 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  37.76 
 
 
512 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  38.2 
 
 
498 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  39.35 
 
 
505 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  38.37 
 
 
511 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  38.12 
 
 
510 aa  286  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  40.23 
 
 
484 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  39.81 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  39.81 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  34.58 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  44.38 
 
 
575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  36.67 
 
 
484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  36.96 
 
 
506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  35.06 
 
 
514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  39.5 
 
 
485 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  40.52 
 
 
485 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  41.54 
 
 
496 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  40.04 
 
 
484 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  33.27 
 
 
509 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  44.05 
 
 
509 aa  279  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  41.17 
 
 
485 aa  279  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  44.03 
 
 
501 aa  279  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  42.41 
 
 
494 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  41.26 
 
 
484 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  40.2 
 
 
483 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  38.72 
 
 
506 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  35.61 
 
 
536 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  36.56 
 
 
541 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  40.51 
 
 
489 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  37.28 
 
 
523 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  39.15 
 
 
491 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  33.61 
 
 
495 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  39.26 
 
 
503 aa  276  8e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  36.38 
 
 
541 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  40.36 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  41.52 
 
 
486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>