More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1833 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11390  acetophenone carboxylase  55.68 
 
 
711 aa  843    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1163  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.13 
 
 
711 aa  844    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1449  acetone carboxylase beta subunit  49.52 
 
 
712 aa  741    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1833  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
731 aa  1489    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1206  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.64 
 
 
725 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2239  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.01 
 
 
708 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2507  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.37 
 
 
708 aa  788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1151  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.63 
 
 
710 aa  846    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4898  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.3 
 
 
709 aa  786    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466599  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4360  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.95 
 
 
708 aa  823    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1848  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.82 
 
 
726 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0551032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1341  hydantoinase/oxoprolinase  50.76 
 
 
450 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2035  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.45 
 
 
701 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.63 
 
 
706 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3717  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.15 
 
 
709 aa  293  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.3 
 
 
674 aa  286  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.39 
 
 
676 aa  283  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  32.14 
 
 
694 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.36 
 
 
682 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.56 
 
 
687 aa  282  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.67 
 
 
765 aa  281  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.1 
 
 
690 aa  280  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1031  acetone carboxylase, beta subunit  28.77 
 
 
717 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1519  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.96 
 
 
690 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4263  hydantoinase/oxoprolinase  28.37 
 
 
723 aa  275  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.62 
 
 
715 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1778  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.5 
 
 
715 aa  274  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20910  Acetone carboxylase beta subunit; AcxA  28.75 
 
 
717 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.36 
 
 
692 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5523  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.65 
 
 
717 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.089614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.68 
 
 
712 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.35 
 
 
693 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3605  hydantoinase/oxoprolinase  28.26 
 
 
717 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.995812  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3509  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.53 
 
 
717 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0697266  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4226  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.23 
 
 
690 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.92 
 
 
673 aa  270  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3471  Hydantoinase/oxoprolinase  28.71 
 
 
716 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
711 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  30.66 
 
 
680 aa  267  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1018  acetone carboxylase, beta subunit  28.47 
 
 
715 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  30.85 
 
 
698 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6172  acetone carboxylase, beta subunit  28.02 
 
 
714 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.23 
 
 
680 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.79 
 
 
683 aa  264  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2237  hydantoinase/oxoprolinase  32.64 
 
 
638 aa  263  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570918  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.32 
 
 
692 aa  262  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.87 
 
 
721 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6150  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.74 
 
 
714 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.353308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0943  hydantoinase/oxoprolinase  27.22 
 
 
715 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.93 
 
 
681 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.83 
 
 
694 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4105  acetone carboxylase subunit beta  28.45 
 
 
722 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  29.22 
 
 
681 aa  261  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.89 
 
 
698 aa  261  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.67 
 
 
680 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.27 
 
 
676 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.01 
 
 
684 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  30.09 
 
 
673 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.76 
 
 
719 aa  258  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.92 
 
 
690 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3515  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.59 
 
 
694 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  31.67 
 
 
686 aa  257  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.59 
 
 
694 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2208  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.66 
 
 
688 aa  256  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170446  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.32 
 
 
691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.12 
 
 
701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.19 
 
 
694 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.99 
 
 
681 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.59 
 
 
684 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1850  hydantoinase/oxoprolinase  28.67 
 
 
647 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.49 
 
 
691 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.39 
 
 
684 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.33 
 
 
702 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.9 
 
 
704 aa  246  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.78 
 
 
690 aa  246  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  30.39 
 
 
679 aa  244  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.85 
 
 
739 aa  243  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.53 
 
 
1206 aa  243  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11410  acetophenone carboxylase  29.4 
 
 
645 aa  242  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.488439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.7 
 
 
658 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  29.23 
 
 
678 aa  242  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.46 
 
 
690 aa  241  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.43 
 
 
682 aa  241  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.28 
 
 
687 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.85 
 
 
694 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  30.08 
 
 
685 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2267  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.7 
 
 
697 aa  239  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  28.24 
 
 
676 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0472  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.14 
 
 
687 aa  238  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4085  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.86 
 
 
706 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.01 
 
 
687 aa  237  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  27.65 
 
 
687 aa  236  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  29.06 
 
 
1362 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  29.54 
 
 
660 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3097  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.97 
 
 
702 aa  234  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364987  normal  0.554031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.28 
 
 
684 aa  234  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.4 
 
 
683 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1980  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.89 
 
 
693 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  29.66 
 
 
1355 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.04 
 
 
707 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>