More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9128 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  100 
 
 
680 aa  1385    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.53 
 
 
683 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.19 
 
 
701 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0377  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.59 
 
 
676 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  39.27 
 
 
676 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.44 
 
 
680 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.77 
 
 
694 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  39.6 
 
 
687 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.76 
 
 
765 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.67 
 
 
680 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.43 
 
 
663 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.17 
 
 
698 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.38 
 
 
674 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.35 
 
 
687 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.96 
 
 
682 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.44 
 
 
676 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.14 
 
 
676 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.5 
 
 
673 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.72 
 
 
694 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.43 
 
 
712 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.04 
 
 
684 aa  429  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.72 
 
 
680 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.53 
 
 
658 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.72 
 
 
657 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.32 
 
 
701 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.43 
 
 
688 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  39.05 
 
 
660 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.83 
 
 
682 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  37.19 
 
 
681 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  38.44 
 
 
685 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.79 
 
 
678 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.85 
 
 
690 aa  422  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.41 
 
 
691 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.64 
 
 
739 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  37.56 
 
 
682 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.08 
 
 
680 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.48 
 
 
687 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.92 
 
 
692 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.89 
 
 
706 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.67 
 
 
672 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.83 
 
 
683 aa  411  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.59 
 
 
692 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.52 
 
 
674 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  38.67 
 
 
672 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.39 
 
 
690 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  39.65 
 
 
686 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  37.16 
 
 
706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1060  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.81 
 
 
684 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.32 
 
 
726 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.6 
 
 
690 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.13 
 
 
681 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.75 
 
 
692 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.52 
 
 
690 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.51 
 
 
692 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.17 
 
 
711 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.01 
 
 
693 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.32 
 
 
702 aa  402  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.06 
 
 
679 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.99 
 
 
681 aa  402  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.84 
 
 
707 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.64 
 
 
690 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  36.14 
 
 
694 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1935  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.41 
 
 
690 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.08 
 
 
691 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.5 
 
 
648 aa  397  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96856  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.38 
 
 
684 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  36.72 
 
 
692 aa  399  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.73 
 
 
704 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1519  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.25 
 
 
690 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.56 
 
 
651 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  36.2 
 
 
687 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  37.48 
 
 
680 aa  389  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  36.91 
 
 
698 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.03 
 
 
691 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  39.41 
 
 
689 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.46 
 
 
652 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.07 
 
 
699 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.66 
 
 
707 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.45 
 
 
684 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.24 
 
 
694 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  36.28 
 
 
679 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.73 
 
 
711 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.65 
 
 
706 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.66 
 
 
694 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0132  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.29 
 
 
647 aa  374  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367806  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3515  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.66 
 
 
694 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1392  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.61 
 
 
657 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.307503  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.47 
 
 
719 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  33.93 
 
 
673 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0425  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.12 
 
 
647 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.82 
 
 
684 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0038  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.68 
 
 
661 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.13 
 
 
690 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0466  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.33 
 
 
649 aa  365  2e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.162226  hitchhiker  0.000000366174 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.93 
 
 
687 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4085  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.65 
 
 
706 aa  364  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.37 
 
 
673 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.6 
 
 
721 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4389  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.05 
 
 
684 aa  361  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  35.83 
 
 
1277 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>