More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  68.99 
 
 
643 aa  883    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1338  hydantoinase/oxoprolinase  73.91 
 
 
643 aa  917    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11410  acetophenone carboxylase  100 
 
 
645 aa  1293    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.488439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1165  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  71.43 
 
 
645 aa  951    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4896  hydantoinase/oxoprolinase  46.76 
 
 
634 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833131  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1451  hydantoinase/oxoprolinase family protein  46.19 
 
 
639 aa  558  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.589264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1204  hydantoinase/oxoprolinase  48.06 
 
 
665 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114789  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2509  hydantoinase/oxoprolinase  44.36 
 
 
637 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212275  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1149  hydantoinase/oxoprolinase  45.78 
 
 
627 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129864  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1831  hydantoinase/oxoprolinase  42.83 
 
 
638 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2237  hydantoinase/oxoprolinase  41.72 
 
 
638 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570918  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1850  hydantoinase/oxoprolinase  33.23 
 
 
647 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11390  acetophenone carboxylase  29.94 
 
 
711 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1163  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.11 
 
 
711 aa  265  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4360  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.28 
 
 
708 aa  264  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2239  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.92 
 
 
708 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1833  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.81 
 
 
731 aa  246  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2507  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.88 
 
 
708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4898  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.24 
 
 
709 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466599  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1449  acetone carboxylase beta subunit  32.14 
 
 
712 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1206  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.11 
 
 
725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1151  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.94 
 
 
710 aa  230  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1848  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.63 
 
 
726 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0551032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.04 
 
 
706 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.52 
 
 
682 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.27 
 
 
690 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.37 
 
 
678 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  29.2 
 
 
694 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.8 
 
 
684 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.04 
 
 
680 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.68 
 
 
765 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.23 
 
 
711 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  32.04 
 
 
686 aa  187  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.46 
 
 
683 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.67 
 
 
684 aa  185  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.45 
 
 
680 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.78 
 
 
692 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.24 
 
 
765 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  28.43 
 
 
676 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.19 
 
 
690 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.1 
 
 
680 aa  178  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.45 
 
 
672 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2035  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.09 
 
 
701 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.48 
 
 
681 aa  177  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.05 
 
 
676 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  28.12 
 
 
672 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.15 
 
 
683 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.29 
 
 
658 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.16 
 
 
706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.88 
 
 
681 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  27.56 
 
 
678 aa  174  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.49 
 
 
652 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.37 
 
 
663 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.82 
 
 
690 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.08 
 
 
704 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.09 
 
 
712 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.68 
 
 
707 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  28.65 
 
 
681 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.09 
 
 
712 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.2 
 
 
680 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.55 
 
 
676 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.88 
 
 
692 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  29.04 
 
 
660 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20910  Acetone carboxylase beta subunit; AcxA  26.73 
 
 
717 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.29 
 
 
694 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.09 
 
 
714 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.82 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1341  hydantoinase/oxoprolinase  30.87 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49044  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.05 
 
 
692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.63 
 
 
707 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2267  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28 
 
 
697 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6150  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.03 
 
 
714 aa  164  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.353308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0472  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.59 
 
 
687 aa  164  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.03 
 
 
698 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  26.42 
 
 
706 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.72 
 
 
684 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.5 
 
 
687 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.8 
 
 
682 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3515  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.01 
 
 
694 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3509  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.31 
 
 
717 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0697266  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.52 
 
 
690 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3471  Hydantoinase/oxoprolinase  26.29 
 
 
716 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  27.64 
 
 
692 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  28.46 
 
 
1355 aa  160  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.5 
 
 
680 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3605  hydantoinase/oxoprolinase  26.64 
 
 
717 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.995812  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1519  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.12 
 
 
690 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.93 
 
 
726 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 
721 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.16 
 
 
691 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.41 
 
 
699 aa  158  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.65 
 
 
739 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.7 
 
 
651 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.79 
 
 
685 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5523  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.07 
 
 
717 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.089614 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.53 
 
 
694 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.2 
 
 
657 aa  157  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  27.2 
 
 
1209 aa  156  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1980  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.24 
 
 
693 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0728  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.28 
 
 
649 aa  156  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>