More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2410 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  57.79 
 
 
726 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
658 aa  1280    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.04 
 
 
701 aa  590  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  48.8 
 
 
739 aa  561  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.52 
 
 
662 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.07 
 
 
663 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.4 
 
 
680 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0038  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.53 
 
 
661 aa  513  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  47.12 
 
 
707 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.3 
 
 
765 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.88 
 
 
683 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1857  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.23 
 
 
674 aa  498  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  41.96 
 
 
676 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  45.7 
 
 
660 aa  485  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  42.56 
 
 
687 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.87 
 
 
680 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.31 
 
 
657 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.02 
 
 
694 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  41.94 
 
 
681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.44 
 
 
680 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.88 
 
 
678 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.18 
 
 
692 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1127  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.34 
 
 
641 aa  462  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.814296  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.05 
 
 
692 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.29 
 
 
691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.13 
 
 
698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.22 
 
 
672 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  43.22 
 
 
672 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.75 
 
 
688 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.71 
 
 
692 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.66 
 
 
683 aa  443  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.46 
 
 
652 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  42.58 
 
 
680 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0377  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.67 
 
 
676 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.03 
 
 
702 aa  442  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.06 
 
 
681 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.06 
 
 
692 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.88 
 
 
687 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.56 
 
 
687 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.52 
 
 
674 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.73 
 
 
673 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.38 
 
 
690 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.16 
 
 
682 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.62 
 
 
681 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  42.54 
 
 
679 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.35 
 
 
684 aa  432  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0728  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.96 
 
 
649 aa  426  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.58 
 
 
674 aa  428  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  39.53 
 
 
680 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.04 
 
 
651 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.01 
 
 
690 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.72 
 
 
704 aa  425  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.43 
 
 
691 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.43 
 
 
706 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.67 
 
 
676 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.68 
 
 
691 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.38 
 
 
690 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.57 
 
 
690 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.21 
 
 
694 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.08 
 
 
682 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.43 
 
 
707 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  43.13 
 
 
686 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1392  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.91 
 
 
657 aa  419  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.307503  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.36 
 
 
648 aa  418  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96856  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.75 
 
 
676 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4085  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.48 
 
 
706 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1519  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.74 
 
 
690 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.7 
 
 
680 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.73 
 
 
679 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  38.63 
 
 
706 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1980  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.09 
 
 
693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  40.66 
 
 
682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  39.56 
 
 
692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0132  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.45 
 
 
647 aa  402  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367806  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  39.07 
 
 
685 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.79 
 
 
687 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.51 
 
 
711 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.51 
 
 
711 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.31 
 
 
699 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.63 
 
 
685 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.07 
 
 
712 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.7 
 
 
684 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0425  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.38 
 
 
647 aa  398  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0466  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.11 
 
 
649 aa  393  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.162226  hitchhiker  0.000000366174 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  37.59 
 
 
673 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.16 
 
 
721 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1060  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.54 
 
 
684 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.62 
 
 
684 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.25 
 
 
701 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.502801 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  38.58 
 
 
1362 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  41.49 
 
 
698 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  38.85 
 
 
1355 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  37.7 
 
 
687 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.46 
 
 
694 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.19 
 
 
693 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.47 
 
 
690 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  37.83 
 
 
694 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3515  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.08 
 
 
694 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.08 
 
 
673 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  39.85 
 
 
689 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>